Protein–RNA interactions for Protein: P70278

Stra8, Stimulated by retinoic acid gene 8 protein, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stra8P70278 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Stra8P70278 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Stra8P70278 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Stra8P70278 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Stra8P70278 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Stra8P70278 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Stra8P70278 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Stra8P70278 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Stra8P70278 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Stra8P70278 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Stra8P70278 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Stra8P70278 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Stra8P70278 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Stra8P70278 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Stra8P70278 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Stra8P70278 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Stra8P70278 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Stra8P70278 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Stra8P70278 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Stra8P70278 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Stra8P70278 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Stra8P70278 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Stra8P70278 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Stra8P70278 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Stra8P70278 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Stra8P70278 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Stra8P70278 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Stra8P70278 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Stra8P70278 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Stra8P70278 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Stra8P70278 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Stra8P70278 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Stra8P70278 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Stra8P70278 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Stra8P70278 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Stra8P70278 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Stra8P70278 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Stra8P70278 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Stra8P70278 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Stra8P70278 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Stra8P70278 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Stra8P70278 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Stra8P70278 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Stra8P70278 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Stra8P70278 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Stra8P70278 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Stra8P70278 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Stra8P70278 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Stra8P70278 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Stra8P70278 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Stra8P70278 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Stra8P70278 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Stra8P70278 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Stra8P70278 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Stra8P70278 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Stra8P70278 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Stra8P70278 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Stra8P70278 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Stra8P70278 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Stra8P70278 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Stra8P70278 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Stra8P70278 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Stra8P70278 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Stra8P70278 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Stra8P70278 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Stra8P70278 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Stra8P70278 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Stra8P70278 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Stra8P70278 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Stra8P70278 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Stra8P70278 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Stra8P70278 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Stra8P70278 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Stra8P70278 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Stra8P70278 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Stra8P70278 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Stra8P70278 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Stra8P70278 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Stra8P70278 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Stra8P70278 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Stra8P70278 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Stra8P70278 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Stra8P70278 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Stra8P70278 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Stra8P70278 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Stra8P70278 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Stra8P70278 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Stra8P70278 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Stra8P70278 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Stra8P70278 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Stra8P70278 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Stra8P70278 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Stra8P70278 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Stra8P70278 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Stra8P70278 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Stra8P70278 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Stra8P70278 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Stra8P70278 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Stra8P70278 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Stra8P70278 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms