Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxd13P70217 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxd13P70217 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxd13P70217 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxd13P70217 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxd13P70217 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxd13P70217 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxd13P70217 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxd13P70217 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxd13P70217 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxd13P70217 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxd13P70217 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxd13P70217 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxd13P70217 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxd13P70217 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxd13P70217 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxd13P70217 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxd13P70217 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxd13P70217 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxd13P70217 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxd13P70217 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxd13P70217 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxd13P70217 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxd13P70217 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxd13P70217 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxd13P70217 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxd13P70217 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxd13P70217 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxd13P70217 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxd13P70217 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxd13P70217 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxd13P70217 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxd13P70217 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxd13P70217 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxd13P70217 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxd13P70217 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxd13P70217 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxd13P70217 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxd13P70217 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxd13P70217 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxd13P70217 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxd13P70217 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxd13P70217 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxd13P70217 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxd13P70217 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxd13P70217 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxd13P70217 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxd13P70217 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxd13P70217 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Hoxd13P70217 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Hoxd13P70217 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Hoxd13P70217 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Hoxd13P70217 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hoxd13P70217 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Hoxd13P70217 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Hoxd13P70217 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hoxd13P70217 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hoxd13P70217 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hoxd13P70217 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hoxd13P70217 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hoxd13P70217 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hoxd13P70217 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hoxd13P70217 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hoxd13P70217 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hoxd13P70217 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxd13P70217 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxd13P70217 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxd13P70217 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxd13P70217 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxd13P70217 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxd13P70217 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxd13P70217 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxd13P70217 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxd13P70217 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxd13P70217 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxd13P70217 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxd13P70217 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxd13P70217 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxd13P70217 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxd13P70217 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxd13P70217 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxd13P70217 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxd13P70217 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxd13P70217 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxd13P70217 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxd13P70217 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxd13P70217 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxd13P70217 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxd13P70217 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxd13P70217 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxd13P70217 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxd13P70217 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxd13P70217 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxd13P70217 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxd13P70217 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxd13P70217 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxd13P70217 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxd13P70217 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxd13P70217 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxd13P70217 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms