Protein–RNA interactions for Protein: P70193

Lrig1, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig1P70193 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Lrig1P70193 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lrig1P70193 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lrig1P70193 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lrig1P70193 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lrig1P70193 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Lrig1P70193 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lrig1P70193 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Lrig1P70193 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lrig1P70193 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Lrig1P70193 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lrig1P70193 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lrig1P70193 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lrig1P70193 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Lrig1P70193 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lrig1P70193 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lrig1P70193 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lrig1P70193 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lrig1P70193 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Lrig1P70193 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Lrig1P70193 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lrig1P70193 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lrig1P70193 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lrig1P70193 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lrig1P70193 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lrig1P70193 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lrig1P70193 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lrig1P70193 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lrig1P70193 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lrig1P70193 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lrig1P70193 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lrig1P70193 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lrig1P70193 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lrig1P70193 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lrig1P70193 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lrig1P70193 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lrig1P70193 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lrig1P70193 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lrig1P70193 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lrig1P70193 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lrig1P70193 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lrig1P70193 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lrig1P70193 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lrig1P70193 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lrig1P70193 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lrig1P70193 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lrig1P70193 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lrig1P70193 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lrig1P70193 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lrig1P70193 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lrig1P70193 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lrig1P70193 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lrig1P70193 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Lrig1P70193 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lrig1P70193 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lrig1P70193 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lrig1P70193 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lrig1P70193 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lrig1P70193 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lrig1P70193 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lrig1P70193 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lrig1P70193 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrig1P70193 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrig1P70193 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrig1P70193 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrig1P70193 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrig1P70193 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrig1P70193 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrig1P70193 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrig1P70193 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrig1P70193 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrig1P70193 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrig1P70193 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrig1P70193 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrig1P70193 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrig1P70193 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrig1P70193 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrig1P70193 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrig1P70193 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrig1P70193 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrig1P70193 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrig1P70193 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lrig1P70193 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lrig1P70193 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lrig1P70193 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lrig1P70193 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lrig1P70193 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lrig1P70193 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lrig1P70193 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lrig1P70193 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lrig1P70193 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lrig1P70193 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lrig1P70193 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lrig1P70193 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lrig1P70193 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lrig1P70193 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Lrig1P70193 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lrig1P70193 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lrig1P70193 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lrig1P70193 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms