Protein–RNA interactions for Protein: P70191

Traf5, TNF receptor-associated factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf5P70191 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Traf5P70191 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Traf5P70191 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Traf5P70191 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Traf5P70191 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Traf5P70191 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Traf5P70191 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Traf5P70191 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Traf5P70191 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Traf5P70191 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Traf5P70191 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Traf5P70191 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Traf5P70191 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Traf5P70191 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Traf5P70191 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Traf5P70191 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Traf5P70191 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Traf5P70191 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Traf5P70191 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Traf5P70191 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Traf5P70191 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Traf5P70191 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Traf5P70191 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Traf5P70191 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Traf5P70191 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Traf5P70191 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Traf5P70191 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Traf5P70191 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Traf5P70191 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Traf5P70191 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Traf5P70191 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Traf5P70191 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Traf5P70191 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Traf5P70191 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Traf5P70191 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Traf5P70191 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Traf5P70191 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Traf5P70191 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Traf5P70191 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Traf5P70191 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Traf5P70191 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Traf5P70191 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Traf5P70191 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Traf5P70191 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Traf5P70191 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Traf5P70191 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Traf5P70191 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Traf5P70191 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Traf5P70191 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Traf5P70191 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Traf5P70191 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Traf5P70191 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Traf5P70191 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Traf5P70191 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Traf5P70191 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
Traf5P70191 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Traf5P70191 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Traf5P70191 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Traf5P70191 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Traf5P70191 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Traf5P70191 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Traf5P70191 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Traf5P70191 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Traf5P70191 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Traf5P70191 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Traf5P70191 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Traf5P70191 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Traf5P70191 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Traf5P70191 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Traf5P70191 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Traf5P70191 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Traf5P70191 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Traf5P70191 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Traf5P70191 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Traf5P70191 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Traf5P70191 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Traf5P70191 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Traf5P70191 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Traf5P70191 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Traf5P70191 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Traf5P70191 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Traf5P70191 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Traf5P70191 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Traf5P70191 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Traf5P70191 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Traf5P70191 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Traf5P70191 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Traf5P70191 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Traf5P70191 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Traf5P70191 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Traf5P70191 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Traf5P70191 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Traf5P70191 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Traf5P70191 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Traf5P70191 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Traf5P70191 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Traf5P70191 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Traf5P70191 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Traf5P70191 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Traf5P70191 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms