Protein–RNA interactions for Protein: P68134

Acta1, Actin, alpha skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acta1P68134 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Acta1P68134 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Acta1P68134 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Acta1P68134 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Acta1P68134 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Acta1P68134 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Acta1P68134 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Acta1P68134 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Acta1P68134 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Acta1P68134 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Acta1P68134 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Acta1P68134 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Acta1P68134 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Acta1P68134 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Acta1P68134 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Acta1P68134 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Acta1P68134 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Acta1P68134 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Acta1P68134 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Acta1P68134 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Acta1P68134 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Acta1P68134 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Acta1P68134 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Acta1P68134 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Acta1P68134 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Acta1P68134 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Acta1P68134 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Acta1P68134 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Acta1P68134 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Acta1P68134 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Acta1P68134 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Acta1P68134 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Acta1P68134 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Acta1P68134 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Acta1P68134 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Acta1P68134 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Acta1P68134 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Acta1P68134 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Acta1P68134 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Acta1P68134 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Acta1P68134 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Acta1P68134 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Acta1P68134 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Acta1P68134 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Acta1P68134 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Acta1P68134 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Acta1P68134 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Acta1P68134 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Acta1P68134 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Acta1P68134 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Acta1P68134 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Acta1P68134 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Acta1P68134 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Acta1P68134 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Acta1P68134 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Acta1P68134 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Acta1P68134 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Acta1P68134 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Acta1P68134 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Acta1P68134 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Acta1P68134 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Acta1P68134 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Acta1P68134 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Acta1P68134 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Acta1P68134 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Acta1P68134 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Acta1P68134 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Acta1P68134 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Acta1P68134 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Acta1P68134 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Acta1P68134 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Acta1P68134 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Acta1P68134 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Acta1P68134 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Acta1P68134 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Acta1P68134 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Acta1P68134 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Acta1P68134 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Acta1P68134 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Acta1P68134 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Acta1P68134 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Acta1P68134 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Acta1P68134 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Acta1P68134 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Acta1P68134 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Acta1P68134 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Acta1P68134 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Acta1P68134 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Acta1P68134 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Acta1P68134 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Acta1P68134 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Acta1P68134 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Acta1P68134 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Acta1P68134 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Acta1P68134 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Acta1P68134 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Acta1P68134 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Acta1P68134 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Acta1P68134 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Acta1P68134 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms