Protein–RNA interactions for Protein: P63260

Actg1, Actin, cytoplasmic 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actg1P63260 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Actg1P63260 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Actg1P63260 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Actg1P63260 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Actg1P63260 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Actg1P63260 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Actg1P63260 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Actg1P63260 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Actg1P63260 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Actg1P63260 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Actg1P63260 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Actg1P63260 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Actg1P63260 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Actg1P63260 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Actg1P63260 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Actg1P63260 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Actg1P63260 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Actg1P63260 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Actg1P63260 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Actg1P63260 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Actg1P63260 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Actg1P63260 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Actg1P63260 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Actg1P63260 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Actg1P63260 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Actg1P63260 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Actg1P63260 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Actg1P63260 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Actg1P63260 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Actg1P63260 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Actg1P63260 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Actg1P63260 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Actg1P63260 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Actg1P63260 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Actg1P63260 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Actg1P63260 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Actg1P63260 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Actg1P63260 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Actg1P63260 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Actg1P63260 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Actg1P63260 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Actg1P63260 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Actg1P63260 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Actg1P63260 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Actg1P63260 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Actg1P63260 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Actg1P63260 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Actg1P63260 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Actg1P63260 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Actg1P63260 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Actg1P63260 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Actg1P63260 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Actg1P63260 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Actg1P63260 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Actg1P63260 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Actg1P63260 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Actg1P63260 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Actg1P63260 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Actg1P63260 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Actg1P63260 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Actg1P63260 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Actg1P63260 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Actg1P63260 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Actg1P63260 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Actg1P63260 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Actg1P63260 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Actg1P63260 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Actg1P63260 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Actg1P63260 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Actg1P63260 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Actg1P63260 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Actg1P63260 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Actg1P63260 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Actg1P63260 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Actg1P63260 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Actg1P63260 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Actg1P63260 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Actg1P63260 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Actg1P63260 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Actg1P63260 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Actg1P63260 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Actg1P63260 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Actg1P63260 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Actg1P63260 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Actg1P63260 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Actg1P63260 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Actg1P63260 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Actg1P63260 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Actg1P63260 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Actg1P63260 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Actg1P63260 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Actg1P63260 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Actg1P63260 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Actg1P63260 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Actg1P63260 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Actg1P63260 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Actg1P63260 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Actg1P63260 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Actg1P63260 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Actg1P63260 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms