Protein–RNA interactions for Protein: P62984

Uba52, Ubiquitin-60S ribosomal protein L40, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uba52P62984 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Uba52P62984 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Uba52P62984 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Uba52P62984 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Uba52P62984 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Uba52P62984 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Uba52P62984 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Uba52P62984 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Uba52P62984 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Uba52P62984 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Uba52P62984 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Uba52P62984 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Uba52P62984 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Uba52P62984 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Uba52P62984 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Uba52P62984 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Uba52P62984 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Uba52P62984 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Uba52P62984 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Uba52P62984 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Uba52P62984 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Uba52P62984 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Uba52P62984 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Uba52P62984 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Uba52P62984 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Uba52P62984 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Uba52P62984 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Uba52P62984 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Uba52P62984 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Uba52P62984 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Uba52P62984 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Uba52P62984 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Uba52P62984 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Uba52P62984 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Uba52P62984 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Uba52P62984 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Uba52P62984 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Uba52P62984 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Uba52P62984 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Uba52P62984 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Uba52P62984 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Uba52P62984 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Uba52P62984 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Uba52P62984 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Uba52P62984 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Uba52P62984 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Uba52P62984 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Uba52P62984 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Uba52P62984 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Uba52P62984 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Uba52P62984 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Uba52P62984 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Uba52P62984 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Uba52P62984 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Uba52P62984 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Uba52P62984 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Uba52P62984 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Uba52P62984 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Uba52P62984 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Uba52P62984 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Uba52P62984 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Uba52P62984 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Uba52P62984 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Uba52P62984 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Uba52P62984 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Uba52P62984 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Uba52P62984 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Uba52P62984 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Uba52P62984 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Uba52P62984 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Uba52P62984 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Uba52P62984 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Uba52P62984 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Uba52P62984 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Uba52P62984 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Uba52P62984 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Uba52P62984 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Uba52P62984 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Uba52P62984 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Uba52P62984 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Uba52P62984 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Uba52P62984 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Uba52P62984 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Uba52P62984 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Uba52P62984 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Uba52P62984 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Uba52P62984 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Uba52P62984 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Uba52P62984 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Uba52P62984 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Uba52P62984 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Uba52P62984 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Uba52P62984 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Uba52P62984 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Uba52P62984 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Uba52P62984 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Uba52P62984 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Uba52P62984 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Uba52P62984 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Uba52P62984 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms