Protein–RNA interactions for Protein: P62908

Rps3, 40S ribosomal protein S3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps3P62908 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rps3P62908 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Rps3P62908 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rps3P62908 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Rps3P62908 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rps3P62908 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rps3P62908 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rps3P62908 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rps3P62908 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rps3P62908 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rps3P62908 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rps3P62908 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rps3P62908 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rps3P62908 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rps3P62908 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rps3P62908 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rps3P62908 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Rps3P62908 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rps3P62908 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rps3P62908 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rps3P62908 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rps3P62908 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rps3P62908 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rps3P62908 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rps3P62908 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rps3P62908 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rps3P62908 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rps3P62908 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rps3P62908 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rps3P62908 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rps3P62908 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rps3P62908 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Rps3P62908 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rps3P62908 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rps3P62908 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rps3P62908 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rps3P62908 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rps3P62908 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rps3P62908 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rps3P62908 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rps3P62908 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rps3P62908 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rps3P62908 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rps3P62908 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rps3P62908 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rps3P62908 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rps3P62908 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Rps3P62908 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rps3P62908 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rps3P62908 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rps3P62908 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rps3P62908 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rps3P62908 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Rps3P62908 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rps3P62908 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rps3P62908 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rps3P62908 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rps3P62908 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rps3P62908 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Rps3P62908 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rps3P62908 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rps3P62908 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rps3P62908 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rps3P62908 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rps3P62908 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rps3P62908 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rps3P62908 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rps3P62908 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rps3P62908 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rps3P62908 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rps3P62908 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rps3P62908 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rps3P62908 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rps3P62908 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rps3P62908 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rps3P62908 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rps3P62908 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rps3P62908 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rps3P62908 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rps3P62908 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rps3P62908 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rps3P62908 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rps3P62908 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rps3P62908 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rps3P62908 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rps3P62908 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rps3P62908 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Rps3P62908 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rps3P62908 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rps3P62908 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rps3P62908 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rps3P62908 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rps3P62908 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rps3P62908 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rps3P62908 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rps3P62908 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rps3P62908 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rps3P62908 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rps3P62908 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rps3P62908 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms