Protein–RNA interactions for Protein: P62858

Rps28, 40S ribosomal protein S28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 69 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps28P62858 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rps28P62858 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rps28P62858 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rps28P62858 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rps28P62858 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rps28P62858 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rps28P62858 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rps28P62858 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rps28P62858 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rps28P62858 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rps28P62858 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rps28P62858 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rps28P62858 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rps28P62858 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rps28P62858 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rps28P62858 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rps28P62858 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rps28P62858 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rps28P62858 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Rps28P62858 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rps28P62858 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rps28P62858 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rps28P62858 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rps28P62858 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rps28P62858 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rps28P62858 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rps28P62858 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rps28P62858 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rps28P62858 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rps28P62858 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rps28P62858 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rps28P62858 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rps28P62858 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rps28P62858 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rps28P62858 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rps28P62858 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rps28P62858 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rps28P62858 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rps28P62858 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rps28P62858 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rps28P62858 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rps28P62858 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Rps28P62858 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rps28P62858 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rps28P62858 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rps28P62858 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rps28P62858 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rps28P62858 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rps28P62858 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rps28P62858 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rps28P62858 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rps28P62858 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rps28P62858 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rps28P62858 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rps28P62858 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rps28P62858 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rps28P62858 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rps28P62858 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rps28P62858 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rps28P62858 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rps28P62858 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rps28P62858 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rps28P62858 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rps28P62858 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rps28P62858 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rps28P62858 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Rps28P62858 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rps28P62858 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rps28P62858 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rps28P62858 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rps28P62858 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rps28P62858 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rps28P62858 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rps28P62858 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rps28P62858 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rps28P62858 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rps28P62858 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rps28P62858 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rps28P62858 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rps28P62858 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rps28P62858 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rps28P62858 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rps28P62858 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rps28P62858 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rps28P62858 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rps28P62858 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rps28P62858 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rps28P62858 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rps28P62858 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rps28P62858 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rps28P62858 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rps28P62858 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rps28P62858 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rps28P62858 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rps28P62858 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rps28P62858 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rps28P62858 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rps28P62858 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rps28P62858 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rps28P62858 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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