Protein–RNA interactions for Protein: P62748

Hpcal1, Hippocalcin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpcal1P62748 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hpcal1P62748 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hpcal1P62748 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hpcal1P62748 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hpcal1P62748 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hpcal1P62748 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hpcal1P62748 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hpcal1P62748 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hpcal1P62748 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hpcal1P62748 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hpcal1P62748 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hpcal1P62748 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hpcal1P62748 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hpcal1P62748 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hpcal1P62748 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hpcal1P62748 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hpcal1P62748 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hpcal1P62748 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hpcal1P62748 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hpcal1P62748 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hpcal1P62748 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hpcal1P62748 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Hpcal1P62748 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hpcal1P62748 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hpcal1P62748 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hpcal1P62748 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hpcal1P62748 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hpcal1P62748 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hpcal1P62748 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hpcal1P62748 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hpcal1P62748 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hpcal1P62748 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hpcal1P62748 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hpcal1P62748 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hpcal1P62748 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hpcal1P62748 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hpcal1P62748 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hpcal1P62748 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hpcal1P62748 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hpcal1P62748 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hpcal1P62748 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hpcal1P62748 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hpcal1P62748 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hpcal1P62748 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hpcal1P62748 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hpcal1P62748 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hpcal1P62748 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Hpcal1P62748 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hpcal1P62748 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hpcal1P62748 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hpcal1P62748 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hpcal1P62748 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hpcal1P62748 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hpcal1P62748 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hpcal1P62748 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hpcal1P62748 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hpcal1P62748 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hpcal1P62748 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hpcal1P62748 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hpcal1P62748 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Hpcal1P62748 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hpcal1P62748 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hpcal1P62748 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hpcal1P62748 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hpcal1P62748 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hpcal1P62748 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hpcal1P62748 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hpcal1P62748 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hpcal1P62748 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hpcal1P62748 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hpcal1P62748 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Hpcal1P62748 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hpcal1P62748 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hpcal1P62748 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Hpcal1P62748 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hpcal1P62748 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hpcal1P62748 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hpcal1P62748 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hpcal1P62748 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hpcal1P62748 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hpcal1P62748 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hpcal1P62748 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hpcal1P62748 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hpcal1P62748 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hpcal1P62748 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hpcal1P62748 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hpcal1P62748 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Hpcal1P62748 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Hpcal1P62748 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hpcal1P62748 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hpcal1P62748 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hpcal1P62748 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hpcal1P62748 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Hpcal1P62748 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Hpcal1P62748 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Hpcal1P62748 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hpcal1P62748 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hpcal1P62748 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hpcal1P62748 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hpcal1P62748 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms