Protein–RNA interactions for Protein: P62737

Acta2, Actin, aortic smooth muscle, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acta2P62737 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Acta2P62737 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Acta2P62737 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Acta2P62737 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Acta2P62737 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Acta2P62737 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Acta2P62737 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Acta2P62737 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Acta2P62737 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Acta2P62737 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Acta2P62737 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Acta2P62737 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Acta2P62737 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Acta2P62737 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Acta2P62737 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Acta2P62737 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Acta2P62737 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Acta2P62737 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Acta2P62737 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Acta2P62737 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Acta2P62737 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Acta2P62737 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Acta2P62737 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Acta2P62737 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Acta2P62737 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Acta2P62737 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Acta2P62737 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Acta2P62737 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Acta2P62737 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Acta2P62737 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Acta2P62737 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Acta2P62737 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Acta2P62737 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Acta2P62737 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Acta2P62737 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Acta2P62737 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Acta2P62737 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Acta2P62737 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Acta2P62737 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Acta2P62737 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Acta2P62737 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Acta2P62737 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Acta2P62737 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Acta2P62737 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Acta2P62737 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Acta2P62737 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Acta2P62737 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Acta2P62737 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Acta2P62737 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Acta2P62737 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Acta2P62737 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Acta2P62737 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Acta2P62737 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Acta2P62737 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Acta2P62737 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Acta2P62737 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Acta2P62737 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Acta2P62737 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Acta2P62737 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Acta2P62737 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Acta2P62737 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Acta2P62737 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Acta2P62737 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Acta2P62737 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Acta2P62737 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Acta2P62737 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Acta2P62737 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Acta2P62737 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Acta2P62737 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Acta2P62737 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Acta2P62737 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Acta2P62737 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Acta2P62737 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Acta2P62737 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Acta2P62737 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Acta2P62737 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Acta2P62737 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Acta2P62737 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Acta2P62737 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Acta2P62737 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Acta2P62737 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Acta2P62737 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Acta2P62737 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Acta2P62737 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Acta2P62737 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Acta2P62737 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Acta2P62737 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Acta2P62737 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Acta2P62737 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Acta2P62737 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Acta2P62737 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Acta2P62737 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Acta2P62737 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Acta2P62737 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Acta2P62737 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Acta2P62737 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Acta2P62737 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Acta2P62737 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Acta2P62737 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Acta2P62737 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms