Protein–RNA interactions for Protein: P62331

Arf6, ADP-ribosylation factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arf6P62331 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Arf6P62331 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Arf6P62331 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Arf6P62331 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Arf6P62331 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Arf6P62331 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Arf6P62331 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Arf6P62331 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Arf6P62331 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Arf6P62331 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Arf6P62331 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Arf6P62331 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Arf6P62331 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Arf6P62331 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Arf6P62331 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Arf6P62331 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Arf6P62331 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Arf6P62331 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Arf6P62331 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Arf6P62331 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Arf6P62331 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Arf6P62331 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Arf6P62331 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Arf6P62331 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Arf6P62331 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Arf6P62331 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Arf6P62331 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Arf6P62331 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Arf6P62331 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Arf6P62331 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Arf6P62331 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Arf6P62331 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Arf6P62331 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Arf6P62331 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Arf6P62331 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Arf6P62331 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Arf6P62331 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Arf6P62331 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Arf6P62331 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Arf6P62331 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Arf6P62331 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Arf6P62331 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Arf6P62331 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Arf6P62331 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Arf6P62331 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Arf6P62331 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Arf6P62331 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Arf6P62331 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Arf6P62331 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Arf6P62331 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Arf6P62331 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Arf6P62331 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Arf6P62331 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Arf6P62331 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Arf6P62331 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Arf6P62331 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Arf6P62331 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Arf6P62331 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Arf6P62331 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Arf6P62331 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Arf6P62331 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Arf6P62331 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Arf6P62331 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Arf6P62331 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Arf6P62331 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Arf6P62331 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Arf6P62331 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
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Arf6P62331 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Arf6P62331 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Arf6P62331 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Arf6P62331 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Arf6P62331 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Arf6P62331 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms