Protein–RNA interactions for Protein: P62315

Snrpd1, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd1P62315 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snrpd1P62315 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snrpd1P62315 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snrpd1P62315 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Snrpd1P62315 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snrpd1P62315 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snrpd1P62315 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snrpd1P62315 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snrpd1P62315 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snrpd1P62315 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snrpd1P62315 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snrpd1P62315 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snrpd1P62315 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snrpd1P62315 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snrpd1P62315 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snrpd1P62315 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snrpd1P62315 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snrpd1P62315 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snrpd1P62315 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snrpd1P62315 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snrpd1P62315 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snrpd1P62315 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snrpd1P62315 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snrpd1P62315 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snrpd1P62315 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snrpd1P62315 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snrpd1P62315 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snrpd1P62315 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snrpd1P62315 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snrpd1P62315 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snrpd1P62315 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snrpd1P62315 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snrpd1P62315 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snrpd1P62315 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snrpd1P62315 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snrpd1P62315 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snrpd1P62315 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snrpd1P62315 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snrpd1P62315 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snrpd1P62315 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snrpd1P62315 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snrpd1P62315 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snrpd1P62315 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snrpd1P62315 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snrpd1P62315 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snrpd1P62315 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Snrpd1P62315 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snrpd1P62315 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snrpd1P62315 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snrpd1P62315 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snrpd1P62315 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snrpd1P62315 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snrpd1P62315 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snrpd1P62315 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snrpd1P62315 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Snrpd1P62315 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Snrpd1P62315 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Snrpd1P62315 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Snrpd1P62315 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Snrpd1P62315 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Snrpd1P62315 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Snrpd1P62315 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Snrpd1P62315 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Snrpd1P62315 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Snrpd1P62315 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Snrpd1P62315 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Snrpd1P62315 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Snrpd1P62315 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Snrpd1P62315 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Snrpd1P62315 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Snrpd1P62315 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Snrpd1P62315 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Snrpd1P62315 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Snrpd1P62315 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snrpd1P62315 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snrpd1P62315 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snrpd1P62315 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snrpd1P62315 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snrpd1P62315 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snrpd1P62315 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snrpd1P62315 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snrpd1P62315 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snrpd1P62315 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snrpd1P62315 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snrpd1P62315 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snrpd1P62315 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snrpd1P62315 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snrpd1P62315 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snrpd1P62315 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snrpd1P62315 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snrpd1P62315 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snrpd1P62315 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snrpd1P62315 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snrpd1P62315 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snrpd1P62315 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Snrpd1P62315 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snrpd1P62315 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snrpd1P62315 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snrpd1P62315 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snrpd1P62315 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms