Protein–RNA interactions for Protein: P62274

Rps29, 40S ribosomal protein S29, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps29P62274 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rps29P62274 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rps29P62274 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rps29P62274 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Rps29P62274 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rps29P62274 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Rps29P62274 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Rps29P62274 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Rps29P62274 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rps29P62274 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rps29P62274 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rps29P62274 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rps29P62274 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rps29P62274 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rps29P62274 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rps29P62274 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rps29P62274 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rps29P62274 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rps29P62274 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rps29P62274 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rps29P62274 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rps29P62274 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rps29P62274 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rps29P62274 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rps29P62274 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rps29P62274 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rps29P62274 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rps29P62274 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rps29P62274 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rps29P62274 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rps29P62274 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rps29P62274 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rps29P62274 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Rps29P62274 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Rps29P62274 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Rps29P62274 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Rps29P62274 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rps29P62274 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rps29P62274 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rps29P62274 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rps29P62274 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rps29P62274 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rps29P62274 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rps29P62274 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rps29P62274 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rps29P62274 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rps29P62274 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rps29P62274 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rps29P62274 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Rps29P62274 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rps29P62274 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rps29P62274 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rps29P62274 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rps29P62274 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rps29P62274 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Rps29P62274 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rps29P62274 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Rps29P62274 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Rps29P62274 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rps29P62274 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Rps29P62274 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Rps29P62274 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Rps29P62274 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rps29P62274 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rps29P62274 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rps29P62274 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rps29P62274 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Rps29P62274 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Rps29P62274 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Rps29P62274 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rps29P62274 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rps29P62274 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Rps29P62274 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Rps29P62274 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rps29P62274 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rps29P62274 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rps29P62274 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rps29P62274 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rps29P62274 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rps29P62274 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rps29P62274 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rps29P62274 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rps29P62274 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rps29P62274 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rps29P62274 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rps29P62274 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rps29P62274 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rps29P62274 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rps29P62274 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rps29P62274 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rps29P62274 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rps29P62274 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rps29P62274 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Rps29P62274 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rps29P62274 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rps29P62274 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rps29P62274 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rps29P62274 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rps29P62274 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rps29P62274 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105.2 ms