Protein–RNA interactions for Protein: P62270

Rps18, 40S ribosomal protein S18, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps18P62270 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rps18P62270 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rps18P62270 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rps18P62270 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rps18P62270 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rps18P62270 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rps18P62270 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rps18P62270 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rps18P62270 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rps18P62270 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rps18P62270 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rps18P62270 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Rps18P62270 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rps18P62270 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rps18P62270 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rps18P62270 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rps18P62270 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rps18P62270 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rps18P62270 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rps18P62270 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rps18P62270 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rps18P62270 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rps18P62270 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rps18P62270 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rps18P62270 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rps18P62270 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rps18P62270 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rps18P62270 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rps18P62270 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rps18P62270 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rps18P62270 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rps18P62270 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rps18P62270 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rps18P62270 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rps18P62270 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rps18P62270 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rps18P62270 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rps18P62270 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rps18P62270 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rps18P62270 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rps18P62270 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rps18P62270 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rps18P62270 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rps18P62270 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rps18P62270 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rps18P62270 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rps18P62270 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rps18P62270 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rps18P62270 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rps18P62270 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rps18P62270 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rps18P62270 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rps18P62270 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rps18P62270 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rps18P62270 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rps18P62270 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rps18P62270 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rps18P62270 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rps18P62270 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rps18P62270 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rps18P62270 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rps18P62270 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rps18P62270 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rps18P62270 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rps18P62270 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rps18P62270 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rps18P62270 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rps18P62270 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rps18P62270 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rps18P62270 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rps18P62270 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rps18P62270 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rps18P62270 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rps18P62270 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rps18P62270 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rps18P62270 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rps18P62270 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rps18P62270 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rps18P62270 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rps18P62270 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rps18P62270 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rps18P62270 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rps18P62270 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rps18P62270 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rps18P62270 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rps18P62270 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rps18P62270 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rps18P62270 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rps18P62270 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rps18P62270 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rps18P62270 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rps18P62270 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rps18P62270 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rps18P62270 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rps18P62270 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rps18P62270 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rps18P62270 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rps18P62270 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rps18P62270 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rps18P62270 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms