Protein–RNA interactions for Protein: P61969

Lmo4, LIM domain transcription factor LMO4, mousemouse

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo4P61969 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Lmo4P61969 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Lmo4P61969 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Lmo4P61969 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Lmo4P61969 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Lmo4P61969 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Lmo4P61969 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Lmo4P61969 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Lmo4P61969 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Lmo4P61969 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Lmo4P61969 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Lmo4P61969 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Lmo4P61969 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Lmo4P61969 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Lmo4P61969 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Lmo4P61969 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Lmo4P61969 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Lmo4P61969 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Lmo4P61969 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Lmo4P61969 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Lmo4P61969 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Lmo4P61969 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Lmo4P61969 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Lmo4P61969 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Lmo4P61969 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Lmo4P61969 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Lmo4P61969 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Lmo4P61969 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Lmo4P61969 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Lmo4P61969 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Lmo4P61969 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Lmo4P61969 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Lmo4P61969 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Lmo4P61969 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Lmo4P61969 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Lmo4P61969 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Lmo4P61969 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Lmo4P61969 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Lmo4P61969 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Lmo4P61969 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Lmo4P61969 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Lmo4P61969 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Lmo4P61969 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Lmo4P61969 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Lmo4P61969 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Lmo4P61969 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Lmo4P61969 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Lmo4P61969 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Lmo4P61969 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Lmo4P61969 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Lmo4P61969 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Lmo4P61969 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Lmo4P61969 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Lmo4P61969 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Lmo4P61969 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Lmo4P61969 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Lmo4P61969 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Lmo4P61969 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Lmo4P61969 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Lmo4P61969 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Lmo4P61969 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Lmo4P61969 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Lmo4P61969 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Lmo4P61969 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Lmo4P61969 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Lmo4P61969 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Lmo4P61969 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Lmo4P61969 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Lmo4P61969 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Lmo4P61969 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Lmo4P61969 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Lmo4P61969 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Lmo4P61969 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Lmo4P61969 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Lmo4P61969 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Lmo4P61969 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Lmo4P61969 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Lmo4P61969 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Lmo4P61969 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Lmo4P61969 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Lmo4P61969 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Lmo4P61969 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Lmo4P61969 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Lmo4P61969 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Lmo4P61969 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Lmo4P61969 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Lmo4P61969 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Lmo4P61969 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Lmo4P61969 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Lmo4P61969 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Lmo4P61969 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Lmo4P61969 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Lmo4P61969 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Lmo4P61969 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Lmo4P61969 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Lmo4P61969 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Lmo4P61969 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Lmo4P61969 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Lmo4P61969 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Lmo4P61969 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms