Protein–RNA interactions for Protein: P61809

Cdk5r1, Cyclin-dependent kinase 5 activator 1, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5r1P61809 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdk5r1P61809 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdk5r1P61809 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdk5r1P61809 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdk5r1P61809 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdk5r1P61809 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdk5r1P61809 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdk5r1P61809 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdk5r1P61809 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdk5r1P61809 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdk5r1P61809 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdk5r1P61809 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdk5r1P61809 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdk5r1P61809 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdk5r1P61809 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdk5r1P61809 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdk5r1P61809 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdk5r1P61809 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdk5r1P61809 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdk5r1P61809 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdk5r1P61809 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdk5r1P61809 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdk5r1P61809 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdk5r1P61809 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdk5r1P61809 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdk5r1P61809 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdk5r1P61809 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdk5r1P61809 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdk5r1P61809 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdk5r1P61809 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdk5r1P61809 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdk5r1P61809 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdk5r1P61809 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdk5r1P61809 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdk5r1P61809 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdk5r1P61809 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdk5r1P61809 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdk5r1P61809 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdk5r1P61809 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdk5r1P61809 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdk5r1P61809 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdk5r1P61809 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdk5r1P61809 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdk5r1P61809 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdk5r1P61809 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdk5r1P61809 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdk5r1P61809 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdk5r1P61809 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdk5r1P61809 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdk5r1P61809 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdk5r1P61809 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdk5r1P61809 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdk5r1P61809 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdk5r1P61809 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdk5r1P61809 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdk5r1P61809 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdk5r1P61809 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdk5r1P61809 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdk5r1P61809 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdk5r1P61809 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdk5r1P61809 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdk5r1P61809 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdk5r1P61809 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdk5r1P61809 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdk5r1P61809 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdk5r1P61809 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdk5r1P61809 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdk5r1P61809 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdk5r1P61809 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdk5r1P61809 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdk5r1P61809 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdk5r1P61809 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdk5r1P61809 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdk5r1P61809 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdk5r1P61809 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdk5r1P61809 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdk5r1P61809 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdk5r1P61809 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdk5r1P61809 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdk5r1P61809 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdk5r1P61809 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdk5r1P61809 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdk5r1P61809 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdk5r1P61809 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdk5r1P61809 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdk5r1P61809 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdk5r1P61809 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdk5r1P61809 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdk5r1P61809 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdk5r1P61809 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdk5r1P61809 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdk5r1P61809 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdk5r1P61809 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdk5r1P61809 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdk5r1P61809 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdk5r1P61809 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdk5r1P61809 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdk5r1P61809 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdk5r1P61809 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdk5r1P61809 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms