Protein–RNA interactions for Protein: P61759

Vbp1, Prefoldin subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vbp1P61759 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vbp1P61759 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Vbp1P61759 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vbp1P61759 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vbp1P61759 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vbp1P61759 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vbp1P61759 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vbp1P61759 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vbp1P61759 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vbp1P61759 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vbp1P61759 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vbp1P61759 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vbp1P61759 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vbp1P61759 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vbp1P61759 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vbp1P61759 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vbp1P61759 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vbp1P61759 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vbp1P61759 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vbp1P61759 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vbp1P61759 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vbp1P61759 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vbp1P61759 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vbp1P61759 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vbp1P61759 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vbp1P61759 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vbp1P61759 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vbp1P61759 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Vbp1P61759 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vbp1P61759 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vbp1P61759 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vbp1P61759 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vbp1P61759 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vbp1P61759 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vbp1P61759 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Vbp1P61759 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Vbp1P61759 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Vbp1P61759 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vbp1P61759 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Vbp1P61759 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vbp1P61759 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vbp1P61759 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vbp1P61759 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vbp1P61759 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vbp1P61759 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vbp1P61759 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vbp1P61759 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vbp1P61759 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vbp1P61759 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vbp1P61759 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vbp1P61759 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vbp1P61759 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vbp1P61759 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vbp1P61759 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vbp1P61759 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vbp1P61759 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vbp1P61759 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vbp1P61759 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vbp1P61759 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vbp1P61759 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vbp1P61759 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vbp1P61759 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vbp1P61759 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vbp1P61759 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vbp1P61759 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vbp1P61759 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vbp1P61759 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vbp1P61759 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vbp1P61759 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vbp1P61759 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vbp1P61759 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vbp1P61759 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vbp1P61759 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vbp1P61759 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Vbp1P61759 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vbp1P61759 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vbp1P61759 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vbp1P61759 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vbp1P61759 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vbp1P61759 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vbp1P61759 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vbp1P61759 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vbp1P61759 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vbp1P61759 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vbp1P61759 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vbp1P61759 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vbp1P61759 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vbp1P61759 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vbp1P61759 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vbp1P61759 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vbp1P61759 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vbp1P61759 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vbp1P61759 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vbp1P61759 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vbp1P61759 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vbp1P61759 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vbp1P61759 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vbp1P61759 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vbp1P61759 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vbp1P61759 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms