Protein–RNA interactions for Protein: P60843

Eif4a1, Eukaryotic initiation factor 4A-I, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif4a1P60843 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Eif4a1P60843 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Eif4a1P60843 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Eif4a1P60843 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Eif4a1P60843 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Eif4a1P60843 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Eif4a1P60843 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Eif4a1P60843 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Eif4a1P60843 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Eif4a1P60843 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Eif4a1P60843 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Eif4a1P60843 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Eif4a1P60843 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Eif4a1P60843 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Eif4a1P60843 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Eif4a1P60843 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Eif4a1P60843 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Eif4a1P60843 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Eif4a1P60843 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Eif4a1P60843 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Eif4a1P60843 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Eif4a1P60843 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Eif4a1P60843 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Eif4a1P60843 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Eif4a1P60843 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Eif4a1P60843 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Eif4a1P60843 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Eif4a1P60843 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Eif4a1P60843 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Eif4a1P60843 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Eif4a1P60843 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Eif4a1P60843 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Eif4a1P60843 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Eif4a1P60843 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Eif4a1P60843 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Eif4a1P60843 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Eif4a1P60843 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Eif4a1P60843 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Eif4a1P60843 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Eif4a1P60843 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Eif4a1P60843 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Eif4a1P60843 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Eif4a1P60843 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Eif4a1P60843 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Eif4a1P60843 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Eif4a1P60843 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Eif4a1P60843 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Eif4a1P60843 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Eif4a1P60843 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Eif4a1P60843 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Eif4a1P60843 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Eif4a1P60843 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Eif4a1P60843 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Eif4a1P60843 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Eif4a1P60843 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Eif4a1P60843 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Eif4a1P60843 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Eif4a1P60843 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Eif4a1P60843 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Eif4a1P60843 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Eif4a1P60843 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Eif4a1P60843 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Eif4a1P60843 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Eif4a1P60843 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Eif4a1P60843 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Eif4a1P60843 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Eif4a1P60843 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Eif4a1P60843 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Eif4a1P60843 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Eif4a1P60843 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Eif4a1P60843 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Eif4a1P60843 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Eif4a1P60843 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Eif4a1P60843 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Eif4a1P60843 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Eif4a1P60843 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Eif4a1P60843 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Eif4a1P60843 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Eif4a1P60843 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Eif4a1P60843 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Eif4a1P60843 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Eif4a1P60843 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Eif4a1P60843 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Eif4a1P60843 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Eif4a1P60843 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Eif4a1P60843 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Eif4a1P60843 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Eif4a1P60843 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Eif4a1P60843 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Eif4a1P60843 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Eif4a1P60843 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Eif4a1P60843 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Eif4a1P60843 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Eif4a1P60843 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Eif4a1P60843 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Eif4a1P60843 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Eif4a1P60843 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Eif4a1P60843 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Eif4a1P60843 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Eif4a1P60843 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms