Protein–RNA interactions for Protein: P59729

Rin3, Ras and Rab interactor 3, mousemouse

Predictions only

Length 980 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rin3P59729 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rin3P59729 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rin3P59729 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Rin3P59729 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rin3P59729 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rin3P59729 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rin3P59729 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rin3P59729 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rin3P59729 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rin3P59729 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rin3P59729 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rin3P59729 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rin3P59729 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rin3P59729 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rin3P59729 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rin3P59729 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rin3P59729 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rin3P59729 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rin3P59729 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rin3P59729 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rin3P59729 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rin3P59729 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rin3P59729 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Rin3P59729 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rin3P59729 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rin3P59729 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rin3P59729 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rin3P59729 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rin3P59729 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rin3P59729 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rin3P59729 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rin3P59729 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rin3P59729 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rin3P59729 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Rin3P59729 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rin3P59729 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rin3P59729 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rin3P59729 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rin3P59729 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rin3P59729 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Rin3P59729 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rin3P59729 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rin3P59729 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rin3P59729 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rin3P59729 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rin3P59729 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rin3P59729 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rin3P59729 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rin3P59729 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rin3P59729 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Rin3P59729 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rin3P59729 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rin3P59729 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Rin3P59729 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rin3P59729 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Rin3P59729 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rin3P59729 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rin3P59729 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rin3P59729 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rin3P59729 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rin3P59729 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rin3P59729 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rin3P59729 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rin3P59729 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rin3P59729 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rin3P59729 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rin3P59729 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rin3P59729 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rin3P59729 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rin3P59729 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rin3P59729 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rin3P59729 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rin3P59729 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rin3P59729 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rin3P59729 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rin3P59729 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rin3P59729 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rin3P59729 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rin3P59729 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rin3P59729 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rin3P59729 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Rin3P59729 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rin3P59729 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Rin3P59729 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rin3P59729 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rin3P59729 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rin3P59729 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rin3P59729 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rin3P59729 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rin3P59729 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rin3P59729 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rin3P59729 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rin3P59729 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rin3P59729 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Rin3P59729 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rin3P59729 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rin3P59729 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rin3P59729 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rin3P59729 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rin3P59729 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms