Protein–RNA interactions for Protein: P59240

Nphp4, Nephrocystin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp4P59240 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nphp4P59240 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nphp4P59240 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nphp4P59240 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nphp4P59240 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Nphp4P59240 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nphp4P59240 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nphp4P59240 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nphp4P59240 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Nphp4P59240 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nphp4P59240 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nphp4P59240 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nphp4P59240 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nphp4P59240 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nphp4P59240 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nphp4P59240 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nphp4P59240 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nphp4P59240 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nphp4P59240 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nphp4P59240 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nphp4P59240 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nphp4P59240 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nphp4P59240 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nphp4P59240 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nphp4P59240 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nphp4P59240 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nphp4P59240 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
Nphp4P59240 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Nphp4P59240 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Nphp4P59240 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Nphp4P59240 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nphp4P59240 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nphp4P59240 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nphp4P59240 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nphp4P59240 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nphp4P59240 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nphp4P59240 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nphp4P59240 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nphp4P59240 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nphp4P59240 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nphp4P59240 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nphp4P59240 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nphp4P59240 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nphp4P59240 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Nphp4P59240 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nphp4P59240 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nphp4P59240 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nphp4P59240 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nphp4P59240 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nphp4P59240 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nphp4P59240 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nphp4P59240 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nphp4P59240 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nphp4P59240 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nphp4P59240 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nphp4P59240 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nphp4P59240 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nphp4P59240 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nphp4P59240 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nphp4P59240 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nphp4P59240 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nphp4P59240 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nphp4P59240 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nphp4P59240 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nphp4P59240 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nphp4P59240 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nphp4P59240 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nphp4P59240 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nphp4P59240 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nphp4P59240 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nphp4P59240 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Nphp4P59240 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nphp4P59240 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nphp4P59240 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nphp4P59240 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nphp4P59240 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nphp4P59240 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nphp4P59240 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nphp4P59240 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nphp4P59240 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nphp4P59240 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nphp4P59240 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nphp4P59240 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nphp4P59240 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nphp4P59240 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nphp4P59240 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nphp4P59240 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Nphp4P59240 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nphp4P59240 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nphp4P59240 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Nphp4P59240 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Nphp4P59240 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Nphp4P59240 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Nphp4P59240 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Nphp4P59240 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Nphp4P59240 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nphp4P59240 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nphp4P59240 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nphp4P59240 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nphp4P59240 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms