Protein–RNA interactions for Protein: P59016

Vps33b, Vacuolar protein sorting-associated protein 33B, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps33bP59016 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vps33bP59016 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vps33bP59016 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vps33bP59016 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Vps33bP59016 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vps33bP59016 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vps33bP59016 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vps33bP59016 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vps33bP59016 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vps33bP59016 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vps33bP59016 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vps33bP59016 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vps33bP59016 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vps33bP59016 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vps33bP59016 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vps33bP59016 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vps33bP59016 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vps33bP59016 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vps33bP59016 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vps33bP59016 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vps33bP59016 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vps33bP59016 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vps33bP59016 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vps33bP59016 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vps33bP59016 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vps33bP59016 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vps33bP59016 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vps33bP59016 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vps33bP59016 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Vps33bP59016 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vps33bP59016 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vps33bP59016 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vps33bP59016 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vps33bP59016 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vps33bP59016 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vps33bP59016 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Vps33bP59016 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Vps33bP59016 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vps33bP59016 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vps33bP59016 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vps33bP59016 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vps33bP59016 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vps33bP59016 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vps33bP59016 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vps33bP59016 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vps33bP59016 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vps33bP59016 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vps33bP59016 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vps33bP59016 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vps33bP59016 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vps33bP59016 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vps33bP59016 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vps33bP59016 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vps33bP59016 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Vps33bP59016 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vps33bP59016 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Vps33bP59016 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vps33bP59016 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Vps33bP59016 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vps33bP59016 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Vps33bP59016 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Vps33bP59016 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vps33bP59016 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vps33bP59016 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vps33bP59016 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vps33bP59016 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vps33bP59016 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vps33bP59016 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vps33bP59016 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vps33bP59016 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vps33bP59016 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vps33bP59016 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vps33bP59016 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vps33bP59016 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vps33bP59016 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Vps33bP59016 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Vps33bP59016 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vps33bP59016 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vps33bP59016 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vps33bP59016 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vps33bP59016 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vps33bP59016 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vps33bP59016 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vps33bP59016 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vps33bP59016 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vps33bP59016 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vps33bP59016 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vps33bP59016 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vps33bP59016 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vps33bP59016 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vps33bP59016 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vps33bP59016 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vps33bP59016 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vps33bP59016 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vps33bP59016 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vps33bP59016 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vps33bP59016 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Vps33bP59016 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vps33bP59016 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vps33bP59016 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms