Protein–RNA interactions for Protein: P58269

Dpf3, Zinc finger protein DPF3, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dpf3P58269 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Dpf3P58269 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Dpf3P58269 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Dpf3P58269 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Dpf3P58269 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Dpf3P58269 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Dpf3P58269 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Dpf3P58269 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Dpf3P58269 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Dpf3P58269 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Dpf3P58269 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Dpf3P58269 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Dpf3P58269 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Dpf3P58269 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Dpf3P58269 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Dpf3P58269 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Dpf3P58269 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Dpf3P58269 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Dpf3P58269 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Dpf3P58269 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Dpf3P58269 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Dpf3P58269 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Dpf3P58269 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Dpf3P58269 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Dpf3P58269 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Dpf3P58269 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Dpf3P58269 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Dpf3P58269 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Dpf3P58269 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Dpf3P58269 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Dpf3P58269 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Dpf3P58269 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Dpf3P58269 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Dpf3P58269 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Dpf3P58269 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Dpf3P58269 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Dpf3P58269 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Dpf3P58269 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Dpf3P58269 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Dpf3P58269 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Dpf3P58269 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Dpf3P58269 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Dpf3P58269 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Dpf3P58269 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Dpf3P58269 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Dpf3P58269 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Dpf3P58269 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Dpf3P58269 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Dpf3P58269 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Dpf3P58269 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Dpf3P58269 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Dpf3P58269 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Dpf3P58269 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Dpf3P58269 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Dpf3P58269 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Dpf3P58269 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Dpf3P58269 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Dpf3P58269 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Dpf3P58269 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Dpf3P58269 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Dpf3P58269 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Dpf3P58269 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Dpf3P58269 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Dpf3P58269 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Dpf3P58269 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Dpf3P58269 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Dpf3P58269 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Dpf3P58269 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Dpf3P58269 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Dpf3P58269 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Dpf3P58269 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Dpf3P58269 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Dpf3P58269 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Dpf3P58269 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Dpf3P58269 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Dpf3P58269 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Dpf3P58269 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Dpf3P58269 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Dpf3P58269 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Dpf3P58269 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Dpf3P58269 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Dpf3P58269 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Dpf3P58269 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Dpf3P58269 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Dpf3P58269 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Dpf3P58269 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Dpf3P58269 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Dpf3P58269 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Dpf3P58269 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Dpf3P58269 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Dpf3P58269 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Dpf3P58269 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Dpf3P58269 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Dpf3P58269 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Dpf3P58269 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Dpf3P58269 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Dpf3P58269 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Dpf3P58269 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Dpf3P58269 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Dpf3P58269 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms