Protein–RNA interactions for Protein: P57725

Samsn1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samsn1P57725 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Samsn1P57725 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Samsn1P57725 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Samsn1P57725 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Samsn1P57725 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Samsn1P57725 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Samsn1P57725 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Samsn1P57725 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Samsn1P57725 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Samsn1P57725 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Samsn1P57725 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Samsn1P57725 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Samsn1P57725 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Samsn1P57725 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Samsn1P57725 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Samsn1P57725 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Samsn1P57725 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Samsn1P57725 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Samsn1P57725 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Samsn1P57725 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Samsn1P57725 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Samsn1P57725 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Samsn1P57725 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Samsn1P57725 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Samsn1P57725 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Samsn1P57725 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Samsn1P57725 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Samsn1P57725 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Samsn1P57725 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Samsn1P57725 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Samsn1P57725 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Samsn1P57725 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Samsn1P57725 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Samsn1P57725 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Samsn1P57725 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Samsn1P57725 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Samsn1P57725 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Samsn1P57725 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Samsn1P57725 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Samsn1P57725 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Samsn1P57725 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Samsn1P57725 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Samsn1P57725 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Samsn1P57725 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Samsn1P57725 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Samsn1P57725 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Samsn1P57725 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Samsn1P57725 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Samsn1P57725 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Samsn1P57725 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Samsn1P57725 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Samsn1P57725 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Samsn1P57725 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Samsn1P57725 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Samsn1P57725 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Samsn1P57725 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Samsn1P57725 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Samsn1P57725 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Samsn1P57725 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Samsn1P57725 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Samsn1P57725 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Samsn1P57725 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Samsn1P57725 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Samsn1P57725 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Samsn1P57725 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Samsn1P57725 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Samsn1P57725 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Samsn1P57725 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Samsn1P57725 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Samsn1P57725 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Samsn1P57725 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Samsn1P57725 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Samsn1P57725 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Samsn1P57725 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Samsn1P57725 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Samsn1P57725 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Samsn1P57725 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Samsn1P57725 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Samsn1P57725 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Samsn1P57725 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Samsn1P57725 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Samsn1P57725 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Samsn1P57725 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Samsn1P57725 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Samsn1P57725 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Samsn1P57725 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Samsn1P57725 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Samsn1P57725 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Samsn1P57725 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Samsn1P57725 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Samsn1P57725 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Samsn1P57725 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Samsn1P57725 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Samsn1P57725 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Samsn1P57725 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Samsn1P57725 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Samsn1P57725 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Samsn1P57725 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Samsn1P57725 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Samsn1P57725 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms