Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn18P56857 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn18P56857 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn18P56857 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn18P56857 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn18P56857 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn18P56857 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn18P56857 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn18P56857 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn18P56857 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn18P56857 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn18P56857 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn18P56857 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn18P56857 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn18P56857 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn18P56857 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn18P56857 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn18P56857 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn18P56857 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn18P56857 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn18P56857 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn18P56857 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn18P56857 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn18P56857 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn18P56857 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn18P56857 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn18P56857 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn18P56857 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn18P56857 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn18P56857 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn18P56857 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn18P56857 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn18P56857 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn18P56857 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn18P56857 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn18P56857 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn18P56857 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn18P56857 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn18P56857 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn18P56857 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn18P56857 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn18P56857 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn18P56857 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn18P56857 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn18P56857 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn18P56857 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn18P56857 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn18P56857 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn18P56857 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn18P56857 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn18P56857 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn18P56857 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn18P56857 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn18P56857 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn18P56857 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn18P56857 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn18P56857 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn18P56857 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn18P56857 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn18P56857 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn18P56857 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn18P56857 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn18P56857 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn18P56857 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn18P56857 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn18P56857 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn18P56857 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn18P56857 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Cldn18P56857 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn18P56857 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn18P56857 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn18P56857 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn18P56857 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn18P56857 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn18P56857 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn18P56857 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn18P56857 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn18P56857 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn18P56857 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn18P56857 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn18P56857 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn18P56857 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn18P56857 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn18P56857 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn18P56857 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn18P56857 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn18P56857 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn18P56857 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn18P56857 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn18P56857 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn18P56857 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn18P56857 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn18P56857 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn18P56857 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn18P56857 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn18P56857 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn18P56857 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn18P56857 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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