Protein–RNA interactions for Protein: P56818

Bace1, Beta-secretase 1, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bace1P56818 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Bace1P56818 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Bace1P56818 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Bace1P56818 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Bace1P56818 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Bace1P56818 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Bace1P56818 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Bace1P56818 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Bace1P56818 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Bace1P56818 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Bace1P56818 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Bace1P56818 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Bace1P56818 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Bace1P56818 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Bace1P56818 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Bace1P56818 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Bace1P56818 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Bace1P56818 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Bace1P56818 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Bace1P56818 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Bace1P56818 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Bace1P56818 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Bace1P56818 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Bace1P56818 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Bace1P56818 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Bace1P56818 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Bace1P56818 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Bace1P56818 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Bace1P56818 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Bace1P56818 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Bace1P56818 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Bace1P56818 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Bace1P56818 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Bace1P56818 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Bace1P56818 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Bace1P56818 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Bace1P56818 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Bace1P56818 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Bace1P56818 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Bace1P56818 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Bace1P56818 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Bace1P56818 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Bace1P56818 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Bace1P56818 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Bace1P56818 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Bace1P56818 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Bace1P56818 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Bace1P56818 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Bace1P56818 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Bace1P56818 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Bace1P56818 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Bace1P56818 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Bace1P56818 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Bace1P56818 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Bace1P56818 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Bace1P56818 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Bace1P56818 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Bace1P56818 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Bace1P56818 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Bace1P56818 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Bace1P56818 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Bace1P56818 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Bace1P56818 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Bace1P56818 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Bace1P56818 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Bace1P56818 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Bace1P56818 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Bace1P56818 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Bace1P56818 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Bace1P56818 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Bace1P56818 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Bace1P56818 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Bace1P56818 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Bace1P56818 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Bace1P56818 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Bace1P56818 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Bace1P56818 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Bace1P56818 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Bace1P56818 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Bace1P56818 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Bace1P56818 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Bace1P56818 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Bace1P56818 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Bace1P56818 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Bace1P56818 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Bace1P56818 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Bace1P56818 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Bace1P56818 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Bace1P56818 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Bace1P56818 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Bace1P56818 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Bace1P56818 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Bace1P56818 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Bace1P56818 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Bace1P56818 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Bace1P56818 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Bace1P56818 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Bace1P56818 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Bace1P56818 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Bace1P56818 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms