Protein–RNA interactions for Protein: P56546

Ctbp2, C-terminal-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctbp2P56546 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctbp2P56546 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctbp2P56546 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctbp2P56546 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctbp2P56546 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctbp2P56546 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctbp2P56546 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctbp2P56546 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctbp2P56546 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctbp2P56546 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctbp2P56546 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctbp2P56546 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctbp2P56546 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctbp2P56546 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctbp2P56546 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctbp2P56546 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctbp2P56546 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctbp2P56546 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctbp2P56546 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctbp2P56546 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctbp2P56546 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctbp2P56546 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctbp2P56546 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctbp2P56546 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctbp2P56546 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctbp2P56546 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctbp2P56546 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctbp2P56546 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctbp2P56546 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctbp2P56546 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctbp2P56546 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctbp2P56546 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctbp2P56546 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctbp2P56546 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctbp2P56546 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctbp2P56546 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctbp2P56546 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctbp2P56546 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctbp2P56546 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctbp2P56546 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctbp2P56546 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctbp2P56546 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctbp2P56546 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctbp2P56546 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctbp2P56546 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctbp2P56546 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctbp2P56546 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctbp2P56546 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctbp2P56546 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctbp2P56546 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctbp2P56546 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctbp2P56546 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctbp2P56546 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctbp2P56546 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ctbp2P56546 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ctbp2P56546 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ctbp2P56546 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ctbp2P56546 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ctbp2P56546 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ctbp2P56546 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ctbp2P56546 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ctbp2P56546 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ctbp2P56546 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ctbp2P56546 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ctbp2P56546 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ctbp2P56546 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ctbp2P56546 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ctbp2P56546 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ctbp2P56546 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ctbp2P56546 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ctbp2P56546 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ctbp2P56546 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ctbp2P56546 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ctbp2P56546 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ctbp2P56546 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ctbp2P56546 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ctbp2P56546 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ctbp2P56546 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ctbp2P56546 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ctbp2P56546 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ctbp2P56546 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ctbp2P56546 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ctbp2P56546 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ctbp2P56546 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ctbp2P56546 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ctbp2P56546 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ctbp2P56546 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ctbp2P56546 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ctbp2P56546 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ctbp2P56546 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ctbp2P56546 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ctbp2P56546 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ctbp2P56546 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ctbp2P56546 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ctbp2P56546 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ctbp2P56546 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ctbp2P56546 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ctbp2P56546 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ctbp2P56546 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ctbp2P56546 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms