Protein–RNA interactions for Protein: P56400

Gp1bb, Platelet glycoprotein Ib beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp1bbP56400 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gp1bbP56400 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gp1bbP56400 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gp1bbP56400 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gp1bbP56400 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gp1bbP56400 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gp1bbP56400 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gp1bbP56400 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gp1bbP56400 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gp1bbP56400 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gp1bbP56400 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gp1bbP56400 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gp1bbP56400 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gp1bbP56400 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gp1bbP56400 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gp1bbP56400 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gp1bbP56400 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gp1bbP56400 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gp1bbP56400 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gp1bbP56400 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gp1bbP56400 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gp1bbP56400 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gp1bbP56400 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gp1bbP56400 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gp1bbP56400 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gp1bbP56400 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gp1bbP56400 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gp1bbP56400 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gp1bbP56400 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gp1bbP56400 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gp1bbP56400 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gp1bbP56400 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Gp1bbP56400 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gp1bbP56400 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gp1bbP56400 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gp1bbP56400 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gp1bbP56400 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gp1bbP56400 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gp1bbP56400 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gp1bbP56400 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gp1bbP56400 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gp1bbP56400 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gp1bbP56400 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gp1bbP56400 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gp1bbP56400 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gp1bbP56400 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gp1bbP56400 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gp1bbP56400 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gp1bbP56400 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gp1bbP56400 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gp1bbP56400 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gp1bbP56400 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Gp1bbP56400 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gp1bbP56400 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gp1bbP56400 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Gp1bbP56400 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gp1bbP56400 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gp1bbP56400 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gp1bbP56400 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gp1bbP56400 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gp1bbP56400 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gp1bbP56400 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gp1bbP56400 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gp1bbP56400 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Gp1bbP56400 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Gp1bbP56400 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gp1bbP56400 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gp1bbP56400 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gp1bbP56400 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gp1bbP56400 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gp1bbP56400 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gp1bbP56400 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gp1bbP56400 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gp1bbP56400 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gp1bbP56400 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gp1bbP56400 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gp1bbP56400 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gp1bbP56400 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gp1bbP56400 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gp1bbP56400 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gp1bbP56400 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gp1bbP56400 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gp1bbP56400 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gp1bbP56400 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gp1bbP56400 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gp1bbP56400 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gp1bbP56400 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gp1bbP56400 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gp1bbP56400 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gp1bbP56400 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Gp1bbP56400 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gp1bbP56400 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gp1bbP56400 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gp1bbP56400 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gp1bbP56400 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gp1bbP56400 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gp1bbP56400 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gp1bbP56400 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gp1bbP56400 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gp1bbP56400 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms