Protein–RNA interactions for Protein: P56393

Cox7b, Cytochrome c oxidase subunit 7B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 80 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox7bP56393 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Cox7bP56393 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cox7bP56393 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cox7bP56393 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cox7bP56393 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cox7bP56393 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cox7bP56393 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cox7bP56393 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cox7bP56393 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cox7bP56393 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cox7bP56393 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cox7bP56393 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cox7bP56393 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cox7bP56393 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cox7bP56393 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cox7bP56393 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cox7bP56393 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cox7bP56393 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cox7bP56393 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cox7bP56393 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cox7bP56393 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cox7bP56393 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cox7bP56393 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cox7bP56393 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cox7bP56393 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cox7bP56393 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cox7bP56393 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cox7bP56393 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cox7bP56393 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cox7bP56393 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cox7bP56393 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cox7bP56393 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cox7bP56393 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cox7bP56393 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cox7bP56393 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cox7bP56393 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cox7bP56393 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cox7bP56393 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cox7bP56393 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cox7bP56393 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cox7bP56393 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cox7bP56393 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cox7bP56393 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cox7bP56393 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Cox7bP56393 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cox7bP56393 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cox7bP56393 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cox7bP56393 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cox7bP56393 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cox7bP56393 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cox7bP56393 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cox7bP56393 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cox7bP56393 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cox7bP56393 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cox7bP56393 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cox7bP56393 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cox7bP56393 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cox7bP56393 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cox7bP56393 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cox7bP56393 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cox7bP56393 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cox7bP56393 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cox7bP56393 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cox7bP56393 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cox7bP56393 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Cox7bP56393 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cox7bP56393 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Cox7bP56393 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cox7bP56393 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cox7bP56393 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Cox7bP56393 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Cox7bP56393 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cox7bP56393 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cox7bP56393 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cox7bP56393 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cox7bP56393 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cox7bP56393 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cox7bP56393 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cox7bP56393 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cox7bP56393 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cox7bP56393 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cox7bP56393 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cox7bP56393 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cox7bP56393 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cox7bP56393 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cox7bP56393 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cox7bP56393 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cox7bP56393 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cox7bP56393 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cox7bP56393 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cox7bP56393 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cox7bP56393 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cox7bP56393 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cox7bP56393 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cox7bP56393 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cox7bP56393 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cox7bP56393 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cox7bP56393 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cox7bP56393 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cox7bP56393 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms