Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sh3bp1P55194 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sh3bp1P55194 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sh3bp1P55194 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sh3bp1P55194 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sh3bp1P55194 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sh3bp1P55194 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sh3bp1P55194 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sh3bp1P55194 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sh3bp1P55194 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Sh3bp1P55194 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sh3bp1P55194 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sh3bp1P55194 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sh3bp1P55194 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sh3bp1P55194 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sh3bp1P55194 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sh3bp1P55194 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sh3bp1P55194 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sh3bp1P55194 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sh3bp1P55194 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sh3bp1P55194 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sh3bp1P55194 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sh3bp1P55194 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sh3bp1P55194 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sh3bp1P55194 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sh3bp1P55194 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sh3bp1P55194 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sh3bp1P55194 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sh3bp1P55194 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Sh3bp1P55194 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sh3bp1P55194 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sh3bp1P55194 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sh3bp1P55194 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sh3bp1P55194 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sh3bp1P55194 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sh3bp1P55194 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sh3bp1P55194 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sh3bp1P55194 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sh3bp1P55194 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sh3bp1P55194 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Sh3bp1P55194 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sh3bp1P55194 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sh3bp1P55194 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sh3bp1P55194 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Sh3bp1P55194 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Sh3bp1P55194 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Sh3bp1P55194 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Sh3bp1P55194 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sh3bp1P55194 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sh3bp1P55194 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sh3bp1P55194 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sh3bp1P55194 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sh3bp1P55194 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sh3bp1P55194 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sh3bp1P55194 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sh3bp1P55194 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sh3bp1P55194 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sh3bp1P55194 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sh3bp1P55194 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sh3bp1P55194 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sh3bp1P55194 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sh3bp1P55194 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sh3bp1P55194 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sh3bp1P55194 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sh3bp1P55194 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sh3bp1P55194 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sh3bp1P55194 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sh3bp1P55194 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sh3bp1P55194 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sh3bp1P55194 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sh3bp1P55194 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sh3bp1P55194 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sh3bp1P55194 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Sh3bp1P55194 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sh3bp1P55194 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sh3bp1P55194 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sh3bp1P55194 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sh3bp1P55194 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sh3bp1P55194 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sh3bp1P55194 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sh3bp1P55194 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sh3bp1P55194 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sh3bp1P55194 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sh3bp1P55194 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sh3bp1P55194 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sh3bp1P55194 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sh3bp1P55194 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sh3bp1P55194 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sh3bp1P55194 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sh3bp1P55194 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sh3bp1P55194 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sh3bp1P55194 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sh3bp1P55194 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sh3bp1P55194 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sh3bp1P55194 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sh3bp1P55194 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sh3bp1P55194 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sh3bp1P55194 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sh3bp1P55194 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sh3bp1P55194 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms