Protein–RNA interactions for Protein: P55097

Ctsk, Cathepsin K, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtskP55097 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CtskP55097 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CtskP55097 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CtskP55097 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CtskP55097 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CtskP55097 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CtskP55097 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CtskP55097 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CtskP55097 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CtskP55097 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CtskP55097 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CtskP55097 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CtskP55097 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CtskP55097 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CtskP55097 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CtskP55097 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CtskP55097 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CtskP55097 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CtskP55097 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CtskP55097 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CtskP55097 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CtskP55097 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CtskP55097 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CtskP55097 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CtskP55097 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CtskP55097 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CtskP55097 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CtskP55097 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CtskP55097 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CtskP55097 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CtskP55097 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CtskP55097 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CtskP55097 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CtskP55097 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CtskP55097 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CtskP55097 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CtskP55097 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CtskP55097 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CtskP55097 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CtskP55097 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CtskP55097 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CtskP55097 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CtskP55097 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CtskP55097 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CtskP55097 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CtskP55097 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CtskP55097 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CtskP55097 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CtskP55097 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CtskP55097 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CtskP55097 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CtskP55097 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CtskP55097 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CtskP55097 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CtskP55097 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CtskP55097 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CtskP55097 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CtskP55097 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CtskP55097 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
CtskP55097 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CtskP55097 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CtskP55097 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CtskP55097 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CtskP55097 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CtskP55097 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CtskP55097 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CtskP55097 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CtskP55097 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CtskP55097 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CtskP55097 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CtskP55097 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CtskP55097 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CtskP55097 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CtskP55097 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CtskP55097 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CtskP55097 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CtskP55097 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CtskP55097 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CtskP55097 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CtskP55097 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CtskP55097 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CtskP55097 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CtskP55097 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CtskP55097 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CtskP55097 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CtskP55097 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CtskP55097 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CtskP55097 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CtskP55097 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CtskP55097 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CtskP55097 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CtskP55097 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CtskP55097 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CtskP55097 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CtskP55097 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CtskP55097 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CtskP55097 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CtskP55097 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CtskP55097 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CtskP55097 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms