Protein–RNA interactions for Protein: P55041

Gem, GTP-binding protein GEM, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GemP55041 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GemP55041 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GemP55041 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GemP55041 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GemP55041 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GemP55041 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GemP55041 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GemP55041 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
GemP55041 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GemP55041 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GemP55041 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GemP55041 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GemP55041 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GemP55041 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GemP55041 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GemP55041 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GemP55041 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GemP55041 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GemP55041 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GemP55041 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
GemP55041 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GemP55041 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GemP55041 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GemP55041 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
GemP55041 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GemP55041 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GemP55041 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GemP55041 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
GemP55041 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
GemP55041 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
GemP55041 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
GemP55041 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GemP55041 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GemP55041 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GemP55041 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GemP55041 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GemP55041 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GemP55041 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
GemP55041 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GemP55041 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
GemP55041 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GemP55041 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GemP55041 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GemP55041 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GemP55041 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GemP55041 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GemP55041 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GemP55041 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GemP55041 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GemP55041 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GemP55041 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GemP55041 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GemP55041 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GemP55041 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GemP55041 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GemP55041 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GemP55041 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
GemP55041 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GemP55041 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
GemP55041 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
GemP55041 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GemP55041 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GemP55041 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GemP55041 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GemP55041 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GemP55041 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GemP55041 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GemP55041 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
GemP55041 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GemP55041 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GemP55041 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GemP55041 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GemP55041 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GemP55041 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GemP55041 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
GemP55041 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GemP55041 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GemP55041 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GemP55041 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GemP55041 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GemP55041 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GemP55041 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GemP55041 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GemP55041 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GemP55041 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GemP55041 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GemP55041 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GemP55041 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GemP55041 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GemP55041 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GemP55041 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GemP55041 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GemP55041 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GemP55041 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GemP55041 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GemP55041 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GemP55041 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GemP55041 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GemP55041 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GemP55041 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms