Protein–RNA interactions for Protein: P54987

Acod1, Cis-aconitate decarboxylase, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acod1P54987 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Acod1P54987 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Acod1P54987 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Acod1P54987 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Acod1P54987 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Acod1P54987 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Acod1P54987 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Acod1P54987 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Acod1P54987 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Acod1P54987 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Acod1P54987 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Acod1P54987 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Acod1P54987 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Acod1P54987 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Acod1P54987 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Acod1P54987 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Acod1P54987 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Acod1P54987 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Acod1P54987 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Acod1P54987 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Acod1P54987 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Acod1P54987 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Acod1P54987 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Acod1P54987 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Acod1P54987 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Acod1P54987 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Acod1P54987 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Acod1P54987 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Acod1P54987 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Acod1P54987 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Acod1P54987 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Acod1P54987 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Acod1P54987 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Acod1P54987 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Acod1P54987 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Acod1P54987 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Acod1P54987 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Acod1P54987 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Acod1P54987 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Acod1P54987 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Acod1P54987 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Acod1P54987 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Acod1P54987 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Acod1P54987 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Acod1P54987 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Acod1P54987 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Acod1P54987 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Acod1P54987 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Acod1P54987 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Acod1P54987 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Acod1P54987 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Acod1P54987 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Acod1P54987 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Acod1P54987 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Acod1P54987 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Acod1P54987 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Acod1P54987 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Acod1P54987 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Acod1P54987 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Acod1P54987 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Acod1P54987 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Acod1P54987 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Acod1P54987 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Acod1P54987 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Acod1P54987 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Acod1P54987 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Acod1P54987 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Acod1P54987 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Acod1P54987 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Acod1P54987 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Acod1P54987 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Acod1P54987 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Acod1P54987 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Acod1P54987 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Acod1P54987 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Acod1P54987 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Acod1P54987 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Acod1P54987 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Acod1P54987 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Acod1P54987 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Acod1P54987 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Acod1P54987 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Acod1P54987 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Acod1P54987 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Acod1P54987 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Acod1P54987 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Acod1P54987 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Acod1P54987 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Acod1P54987 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Acod1P54987 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Acod1P54987 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Acod1P54987 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Acod1P54987 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Acod1P54987 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Acod1P54987 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Acod1P54987 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Acod1P54987 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Acod1P54987 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Acod1P54987 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Acod1P54987 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms