Protein–RNA interactions for Protein: P51678

Ccr3, Probable C-C chemokine receptor type 3, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr3P51678 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccr3P51678 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccr3P51678 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccr3P51678 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccr3P51678 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccr3P51678 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccr3P51678 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccr3P51678 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccr3P51678 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccr3P51678 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccr3P51678 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccr3P51678 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccr3P51678 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccr3P51678 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccr3P51678 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccr3P51678 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccr3P51678 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccr3P51678 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccr3P51678 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccr3P51678 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccr3P51678 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccr3P51678 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccr3P51678 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccr3P51678 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccr3P51678 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccr3P51678 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccr3P51678 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccr3P51678 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccr3P51678 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccr3P51678 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccr3P51678 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccr3P51678 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccr3P51678 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccr3P51678 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccr3P51678 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccr3P51678 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccr3P51678 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccr3P51678 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccr3P51678 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccr3P51678 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccr3P51678 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccr3P51678 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccr3P51678 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccr3P51678 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccr3P51678 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccr3P51678 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccr3P51678 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccr3P51678 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccr3P51678 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccr3P51678 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccr3P51678 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccr3P51678 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccr3P51678 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccr3P51678 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccr3P51678 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccr3P51678 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccr3P51678 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccr3P51678 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccr3P51678 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccr3P51678 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccr3P51678 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccr3P51678 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccr3P51678 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccr3P51678 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccr3P51678 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccr3P51678 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccr3P51678 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccr3P51678 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccr3P51678 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccr3P51678 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccr3P51678 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccr3P51678 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccr3P51678 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccr3P51678 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccr3P51678 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccr3P51678 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccr3P51678 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccr3P51678 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccr3P51678 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccr3P51678 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccr3P51678 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccr3P51678 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccr3P51678 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccr3P51678 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccr3P51678 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccr3P51678 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccr3P51678 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccr3P51678 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccr3P51678 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccr3P51678 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccr3P51678 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccr3P51678 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccr3P51678 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccr3P51678 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccr3P51678 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccr3P51678 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccr3P51678 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccr3P51678 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccr3P51678 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccr3P51678 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms