Protein–RNA interactions for Protein: P51125

Cast, Calpastatin, mousemouse

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CastP51125 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CastP51125 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CastP51125 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CastP51125 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CastP51125 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CastP51125 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CastP51125 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CastP51125 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CastP51125 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CastP51125 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CastP51125 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CastP51125 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CastP51125 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CastP51125 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CastP51125 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CastP51125 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CastP51125 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CastP51125 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CastP51125 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CastP51125 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CastP51125 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CastP51125 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CastP51125 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CastP51125 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CastP51125 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CastP51125 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CastP51125 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CastP51125 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CastP51125 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CastP51125 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CastP51125 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CastP51125 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CastP51125 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CastP51125 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CastP51125 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CastP51125 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CastP51125 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CastP51125 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CastP51125 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CastP51125 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CastP51125 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CastP51125 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CastP51125 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CastP51125 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CastP51125 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CastP51125 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CastP51125 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CastP51125 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CastP51125 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CastP51125 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CastP51125 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CastP51125 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CastP51125 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CastP51125 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CastP51125 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CastP51125 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CastP51125 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CastP51125 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CastP51125 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CastP51125 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CastP51125 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CastP51125 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CastP51125 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CastP51125 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CastP51125 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CastP51125 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CastP51125 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CastP51125 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CastP51125 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CastP51125 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CastP51125 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CastP51125 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CastP51125 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CastP51125 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CastP51125 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CastP51125 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CastP51125 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CastP51125 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CastP51125 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CastP51125 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CastP51125 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CastP51125 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CastP51125 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CastP51125 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CastP51125 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CastP51125 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CastP51125 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CastP51125 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CastP51125 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CastP51125 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CastP51125 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CastP51125 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CastP51125 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CastP51125 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CastP51125 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CastP51125 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CastP51125 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CastP51125 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CastP51125 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CastP51125 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms