Protein–RNA interactions for Protein: P50637

Tspo, Translocator protein, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TspoP50637 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
TspoP50637 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TspoP50637 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TspoP50637 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TspoP50637 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TspoP50637 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TspoP50637 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TspoP50637 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TspoP50637 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TspoP50637 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TspoP50637 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TspoP50637 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TspoP50637 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TspoP50637 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
TspoP50637 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TspoP50637 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TspoP50637 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TspoP50637 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TspoP50637 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TspoP50637 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TspoP50637 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TspoP50637 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TspoP50637 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TspoP50637 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TspoP50637 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TspoP50637 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TspoP50637 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TspoP50637 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
TspoP50637 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TspoP50637 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
TspoP50637 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TspoP50637 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TspoP50637 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TspoP50637 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TspoP50637 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TspoP50637 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TspoP50637 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TspoP50637 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TspoP50637 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TspoP50637 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TspoP50637 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TspoP50637 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
TspoP50637 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TspoP50637 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TspoP50637 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TspoP50637 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TspoP50637 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TspoP50637 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TspoP50637 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TspoP50637 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TspoP50637 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TspoP50637 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TspoP50637 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TspoP50637 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TspoP50637 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TspoP50637 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TspoP50637 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TspoP50637 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TspoP50637 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TspoP50637 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TspoP50637 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TspoP50637 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TspoP50637 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TspoP50637 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TspoP50637 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
TspoP50637 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TspoP50637 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TspoP50637 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TspoP50637 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TspoP50637 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TspoP50637 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TspoP50637 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
TspoP50637 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TspoP50637 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TspoP50637 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TspoP50637 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TspoP50637 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TspoP50637 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TspoP50637 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TspoP50637 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TspoP50637 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TspoP50637 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TspoP50637 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TspoP50637 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TspoP50637 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TspoP50637 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TspoP50637 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TspoP50637 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TspoP50637 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TspoP50637 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TspoP50637 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TspoP50637 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TspoP50637 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TspoP50637 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TspoP50637 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TspoP50637 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TspoP50637 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TspoP50637 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TspoP50637 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TspoP50637 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms