Protein–RNA interactions for Protein: P50228

Cxcl5, C-X-C motif chemokine 5, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl5P50228 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cxcl5P50228 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cxcl5P50228 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cxcl5P50228 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cxcl5P50228 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cxcl5P50228 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cxcl5P50228 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cxcl5P50228 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cxcl5P50228 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cxcl5P50228 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cxcl5P50228 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cxcl5P50228 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cxcl5P50228 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cxcl5P50228 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cxcl5P50228 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cxcl5P50228 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cxcl5P50228 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cxcl5P50228 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cxcl5P50228 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cxcl5P50228 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cxcl5P50228 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cxcl5P50228 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cxcl5P50228 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cxcl5P50228 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cxcl5P50228 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cxcl5P50228 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cxcl5P50228 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cxcl5P50228 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cxcl5P50228 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cxcl5P50228 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cxcl5P50228 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cxcl5P50228 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cxcl5P50228 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cxcl5P50228 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cxcl5P50228 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cxcl5P50228 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cxcl5P50228 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cxcl5P50228 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cxcl5P50228 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cxcl5P50228 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cxcl5P50228 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cxcl5P50228 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cxcl5P50228 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cxcl5P50228 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cxcl5P50228 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cxcl5P50228 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cxcl5P50228 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cxcl5P50228 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cxcl5P50228 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cxcl5P50228 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cxcl5P50228 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cxcl5P50228 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cxcl5P50228 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cxcl5P50228 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cxcl5P50228 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cxcl5P50228 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cxcl5P50228 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cxcl5P50228 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cxcl5P50228 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cxcl5P50228 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cxcl5P50228 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cxcl5P50228 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cxcl5P50228 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cxcl5P50228 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cxcl5P50228 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cxcl5P50228 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cxcl5P50228 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cxcl5P50228 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cxcl5P50228 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cxcl5P50228 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cxcl5P50228 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cxcl5P50228 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cxcl5P50228 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cxcl5P50228 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cxcl5P50228 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cxcl5P50228 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cxcl5P50228 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cxcl5P50228 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cxcl5P50228 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cxcl5P50228 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cxcl5P50228 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cxcl5P50228 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cxcl5P50228 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cxcl5P50228 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cxcl5P50228 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cxcl5P50228 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cxcl5P50228 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cxcl5P50228 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cxcl5P50228 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cxcl5P50228 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cxcl5P50228 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cxcl5P50228 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cxcl5P50228 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cxcl5P50228 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cxcl5P50228 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cxcl5P50228 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cxcl5P50228 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cxcl5P50228 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cxcl5P50228 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cxcl5P50228 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms