Protein–RNA interactions for Protein: P49962

Srp9, Signal recognition particle 9 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp9P49962 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Srp9P49962 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Srp9P49962 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Srp9P49962 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Srp9P49962 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Srp9P49962 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Srp9P49962 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Srp9P49962 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Srp9P49962 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Srp9P49962 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Srp9P49962 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Srp9P49962 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Srp9P49962 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Srp9P49962 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Srp9P49962 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Srp9P49962 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Srp9P49962 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Srp9P49962 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Srp9P49962 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Srp9P49962 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Srp9P49962 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Srp9P49962 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Srp9P49962 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Srp9P49962 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Srp9P49962 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Srp9P49962 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Srp9P49962 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Srp9P49962 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Srp9P49962 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Srp9P49962 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Srp9P49962 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Srp9P49962 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Srp9P49962 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Srp9P49962 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Srp9P49962 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Srp9P49962 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Srp9P49962 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Srp9P49962 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Srp9P49962 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Srp9P49962 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Srp9P49962 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Srp9P49962 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Srp9P49962 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Srp9P49962 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Srp9P49962 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Srp9P49962 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Srp9P49962 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Srp9P49962 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Srp9P49962 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Srp9P49962 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Srp9P49962 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Srp9P49962 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Srp9P49962 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Srp9P49962 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Srp9P49962 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Srp9P49962 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Srp9P49962 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Srp9P49962 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Srp9P49962 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Srp9P49962 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Srp9P49962 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Srp9P49962 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Srp9P49962 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Srp9P49962 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Srp9P49962 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Srp9P49962 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Srp9P49962 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Srp9P49962 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Srp9P49962 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Srp9P49962 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Srp9P49962 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Srp9P49962 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Srp9P49962 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Srp9P49962 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Srp9P49962 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Srp9P49962 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Srp9P49962 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Srp9P49962 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Srp9P49962 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Srp9P49962 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Srp9P49962 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Srp9P49962 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Srp9P49962 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Srp9P49962 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Srp9P49962 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Srp9P49962 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Srp9P49962 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.07■□□□□ 0
Srp9P49962 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Srp9P49962 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Srp9P49962 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Srp9P49962 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Srp9P49962 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Srp9P49962 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Srp9P49962 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Srp9P49962 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Srp9P49962 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Srp9P49962 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Srp9P49962 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Srp9P49962 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Srp9P49962 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms