Protein–RNA interactions for Protein: P49817

Cav1, Caveolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cav1P49817 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cav1P49817 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cav1P49817 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cav1P49817 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Cav1P49817 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cav1P49817 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cav1P49817 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cav1P49817 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cav1P49817 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cav1P49817 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cav1P49817 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cav1P49817 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cav1P49817 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cav1P49817 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cav1P49817 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Cav1P49817 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cav1P49817 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cav1P49817 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Cav1P49817 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cav1P49817 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Cav1P49817 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cav1P49817 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cav1P49817 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cav1P49817 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cav1P49817 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cav1P49817 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cav1P49817 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cav1P49817 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cav1P49817 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cav1P49817 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cav1P49817 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cav1P49817 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cav1P49817 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cav1P49817 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cav1P49817 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cav1P49817 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cav1P49817 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cav1P49817 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cav1P49817 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cav1P49817 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Cav1P49817 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cav1P49817 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cav1P49817 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cav1P49817 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cav1P49817 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cav1P49817 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cav1P49817 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cav1P49817 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cav1P49817 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cav1P49817 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cav1P49817 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cav1P49817 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cav1P49817 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cav1P49817 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cav1P49817 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cav1P49817 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cav1P49817 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cav1P49817 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cav1P49817 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cav1P49817 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cav1P49817 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cav1P49817 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cav1P49817 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cav1P49817 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cav1P49817 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cav1P49817 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cav1P49817 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cav1P49817 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cav1P49817 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cav1P49817 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cav1P49817 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cav1P49817 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cav1P49817 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cav1P49817 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cav1P49817 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cav1P49817 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cav1P49817 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cav1P49817 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cav1P49817 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cav1P49817 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cav1P49817 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cav1P49817 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cav1P49817 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cav1P49817 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cav1P49817 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cav1P49817 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cav1P49817 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cav1P49817 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cav1P49817 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cav1P49817 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cav1P49817 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cav1P49817 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cav1P49817 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cav1P49817 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cav1P49817 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cav1P49817 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cav1P49817 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cav1P49817 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cav1P49817 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cav1P49817 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms