Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Tmod1P49813 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Tmod1P49813 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Tmod1P49813 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Tmod1P49813 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Tmod1P49813 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Tmod1P49813 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Tmod1P49813 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
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Tmod1P49813 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
Tmod1P49813 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
Tmod1P49813 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
Tmod1P49813 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Tmod1P49813 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Tmod1P49813 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Tmod1P49813 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
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Tmod1P49813 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Tmod1P49813 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Tmod1P49813 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Tmod1P49813 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Tmod1P49813 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Tmod1P49813 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Tmod1P49813 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Tmod1P49813 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Tmod1P49813 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Tmod1P49813 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Tmod1P49813 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Tmod1P49813 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Tmod1P49813 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Tmod1P49813 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Tmod1P49813 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Tmod1P49813 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Tmod1P49813 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Tmod1P49813 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Tmod1P49813 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Tmod1P49813 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Tmod1P49813 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Tmod1P49813 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Tmod1P49813 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Tmod1P49813 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Tmod1P49813 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Tmod1P49813 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Tmod1P49813 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tmod1P49813 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tmod1P49813 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tmod1P49813 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tmod1P49813 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tmod1P49813 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tmod1P49813 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tmod1P49813 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tmod1P49813 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tmod1P49813 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tmod1P49813 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Tmod1P49813 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tmod1P49813 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tmod1P49813 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tmod1P49813 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tmod1P49813 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tmod1P49813 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tmod1P49813 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tmod1P49813 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tmod1P49813 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tmod1P49813 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tmod1P49813 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tmod1P49813 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tmod1P49813 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
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Tmod1P49813 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tmod1P49813 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tmod1P49813 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tmod1P49813 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tmod1P49813 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tmod1P49813 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tmod1P49813 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tmod1P49813 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tmod1P49813 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tmod1P49813 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tmod1P49813 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tmod1P49813 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tmod1P49813 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tmod1P49813 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tmod1P49813 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tmod1P49813 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tmod1P49813 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tmod1P49813 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Tmod1P49813 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tmod1P49813 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tmod1P49813 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tmod1P49813 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tmod1P49813 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tmod1P49813 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tmod1P49813 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Tmod1P49813 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tmod1P49813 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tmod1P49813 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tmod1P49813 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tmod1P49813 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tmod1P49813 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tmod1P49813 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
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