Protein–RNA interactions for Protein: P49769

Psen1, Presenilin-1, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psen1P49769 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Psen1P49769 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Psen1P49769 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Psen1P49769 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Psen1P49769 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Psen1P49769 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Psen1P49769 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Psen1P49769 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Psen1P49769 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Psen1P49769 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Psen1P49769 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Psen1P49769 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Psen1P49769 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Psen1P49769 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Psen1P49769 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Psen1P49769 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Psen1P49769 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Psen1P49769 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Psen1P49769 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Psen1P49769 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Psen1P49769 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Psen1P49769 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Psen1P49769 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Psen1P49769 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Psen1P49769 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Psen1P49769 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Psen1P49769 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Psen1P49769 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Psen1P49769 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Psen1P49769 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Psen1P49769 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Psen1P49769 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Psen1P49769 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Psen1P49769 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Psen1P49769 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Psen1P49769 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Psen1P49769 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Psen1P49769 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Psen1P49769 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Psen1P49769 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Psen1P49769 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Psen1P49769 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Psen1P49769 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Psen1P49769 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Psen1P49769 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Psen1P49769 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Psen1P49769 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Psen1P49769 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Psen1P49769 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Psen1P49769 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Psen1P49769 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Psen1P49769 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Psen1P49769 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Psen1P49769 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Psen1P49769 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Psen1P49769 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Psen1P49769 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Psen1P49769 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Psen1P49769 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Psen1P49769 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Psen1P49769 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Psen1P49769 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Psen1P49769 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Psen1P49769 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Psen1P49769 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Psen1P49769 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Psen1P49769 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Psen1P49769 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Psen1P49769 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Psen1P49769 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Psen1P49769 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Psen1P49769 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Psen1P49769 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Psen1P49769 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Psen1P49769 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Psen1P49769 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Psen1P49769 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Psen1P49769 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Psen1P49769 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Psen1P49769 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Psen1P49769 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Psen1P49769 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Psen1P49769 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Psen1P49769 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Psen1P49769 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Psen1P49769 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Psen1P49769 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Psen1P49769 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Psen1P49769 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Psen1P49769 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Psen1P49769 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Psen1P49769 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Psen1P49769 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Psen1P49769 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Psen1P49769 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Psen1P49769 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Psen1P49769 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Psen1P49769 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Psen1P49769 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Psen1P49769 Zcwpw2-202ENSMUST00000187329 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms