Protein–RNA interactions for Protein: P48772

Cox8b, Cytochrome c oxidase subunit 8B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 70 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox8bP48772 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cox8bP48772 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cox8bP48772 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cox8bP48772 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cox8bP48772 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cox8bP48772 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cox8bP48772 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cox8bP48772 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cox8bP48772 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cox8bP48772 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cox8bP48772 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cox8bP48772 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cox8bP48772 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cox8bP48772 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cox8bP48772 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cox8bP48772 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cox8bP48772 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cox8bP48772 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cox8bP48772 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cox8bP48772 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Cox8bP48772 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Cox8bP48772 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Cox8bP48772 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Cox8bP48772 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Cox8bP48772 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cox8bP48772 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cox8bP48772 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cox8bP48772 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cox8bP48772 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cox8bP48772 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cox8bP48772 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cox8bP48772 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cox8bP48772 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cox8bP48772 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cox8bP48772 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cox8bP48772 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cox8bP48772 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cox8bP48772 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cox8bP48772 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cox8bP48772 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cox8bP48772 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cox8bP48772 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cox8bP48772 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cox8bP48772 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cox8bP48772 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cox8bP48772 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cox8bP48772 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cox8bP48772 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cox8bP48772 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cox8bP48772 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Cox8bP48772 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cox8bP48772 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cox8bP48772 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cox8bP48772 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Cox8bP48772 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cox8bP48772 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cox8bP48772 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cox8bP48772 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cox8bP48772 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cox8bP48772 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cox8bP48772 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cox8bP48772 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cox8bP48772 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cox8bP48772 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cox8bP48772 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cox8bP48772 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cox8bP48772 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cox8bP48772 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cox8bP48772 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cox8bP48772 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cox8bP48772 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cox8bP48772 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cox8bP48772 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cox8bP48772 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cox8bP48772 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cox8bP48772 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cox8bP48772 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cox8bP48772 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cox8bP48772 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cox8bP48772 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cox8bP48772 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cox8bP48772 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cox8bP48772 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cox8bP48772 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cox8bP48772 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cox8bP48772 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cox8bP48772 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cox8bP48772 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cox8bP48772 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cox8bP48772 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cox8bP48772 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cox8bP48772 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Cox8bP48772 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cox8bP48772 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cox8bP48772 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cox8bP48772 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cox8bP48772 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cox8bP48772 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cox8bP48772 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cox8bP48772 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.3 ms