Protein–RNA interactions for Protein: P48432

Sox2, Transcription factor SOX-2, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox2P48432 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sox2P48432 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sox2P48432 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Sox2P48432 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Sox2P48432 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sox2P48432 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sox2P48432 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sox2P48432 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sox2P48432 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sox2P48432 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sox2P48432 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Sox2P48432 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sox2P48432 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sox2P48432 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sox2P48432 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sox2P48432 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sox2P48432 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sox2P48432 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Sox2P48432 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sox2P48432 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sox2P48432 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sox2P48432 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sox2P48432 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sox2P48432 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sox2P48432 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sox2P48432 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sox2P48432 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sox2P48432 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sox2P48432 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sox2P48432 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sox2P48432 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sox2P48432 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sox2P48432 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sox2P48432 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sox2P48432 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sox2P48432 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sox2P48432 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sox2P48432 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sox2P48432 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sox2P48432 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sox2P48432 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sox2P48432 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sox2P48432 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sox2P48432 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sox2P48432 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sox2P48432 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sox2P48432 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sox2P48432 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sox2P48432 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sox2P48432 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sox2P48432 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sox2P48432 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sox2P48432 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sox2P48432 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sox2P48432 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sox2P48432 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sox2P48432 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sox2P48432 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sox2P48432 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sox2P48432 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sox2P48432 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Sox2P48432 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sox2P48432 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sox2P48432 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sox2P48432 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sox2P48432 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sox2P48432 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sox2P48432 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sox2P48432 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sox2P48432 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sox2P48432 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sox2P48432 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sox2P48432 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sox2P48432 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sox2P48432 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sox2P48432 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sox2P48432 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Sox2P48432 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Sox2P48432 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sox2P48432 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sox2P48432 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sox2P48432 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sox2P48432 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sox2P48432 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sox2P48432 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sox2P48432 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sox2P48432 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sox2P48432 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sox2P48432 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sox2P48432 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sox2P48432 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sox2P48432 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sox2P48432 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sox2P48432 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sox2P48432 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Sox2P48432 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sox2P48432 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sox2P48432 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sox2P48432 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sox2P48432 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms