Protein–RNA interactions for Protein: P48031

Gbx2, Homeobox protein GBX-2, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx2P48031 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gbx2P48031 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gbx2P48031 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gbx2P48031 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gbx2P48031 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gbx2P48031 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gbx2P48031 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gbx2P48031 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gbx2P48031 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gbx2P48031 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gbx2P48031 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gbx2P48031 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gbx2P48031 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gbx2P48031 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gbx2P48031 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gbx2P48031 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gbx2P48031 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gbx2P48031 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gbx2P48031 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Gbx2P48031 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gbx2P48031 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gbx2P48031 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gbx2P48031 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gbx2P48031 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Gbx2P48031 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gbx2P48031 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gbx2P48031 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gbx2P48031 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gbx2P48031 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gbx2P48031 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gbx2P48031 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gbx2P48031 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gbx2P48031 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gbx2P48031 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gbx2P48031 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gbx2P48031 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gbx2P48031 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gbx2P48031 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gbx2P48031 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gbx2P48031 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gbx2P48031 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gbx2P48031 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gbx2P48031 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gbx2P48031 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gbx2P48031 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gbx2P48031 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Gbx2P48031 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gbx2P48031 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gbx2P48031 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Gbx2P48031 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gbx2P48031 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gbx2P48031 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gbx2P48031 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gbx2P48031 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gbx2P48031 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gbx2P48031 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gbx2P48031 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gbx2P48031 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gbx2P48031 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gbx2P48031 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gbx2P48031 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gbx2P48031 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gbx2P48031 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gbx2P48031 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gbx2P48031 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gbx2P48031 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gbx2P48031 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gbx2P48031 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gbx2P48031 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gbx2P48031 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gbx2P48031 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gbx2P48031 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gbx2P48031 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gbx2P48031 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gbx2P48031 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gbx2P48031 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gbx2P48031 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gbx2P48031 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gbx2P48031 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gbx2P48031 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gbx2P48031 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Gbx2P48031 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gbx2P48031 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Gbx2P48031 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gbx2P48031 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gbx2P48031 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gbx2P48031 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gbx2P48031 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gbx2P48031 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gbx2P48031 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gbx2P48031 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gbx2P48031 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Gbx2P48031 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gbx2P48031 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gbx2P48031 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gbx2P48031 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gbx2P48031 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gbx2P48031 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gbx2P48031 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gbx2P48031 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms