Protein–RNA interactions for Protein: P47955

Rplp1, 60S acidic ribosomal protein P1, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rplp1P47955 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rplp1P47955 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rplp1P47955 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rplp1P47955 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rplp1P47955 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rplp1P47955 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rplp1P47955 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rplp1P47955 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rplp1P47955 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rplp1P47955 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rplp1P47955 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rplp1P47955 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rplp1P47955 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rplp1P47955 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rplp1P47955 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rplp1P47955 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rplp1P47955 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rplp1P47955 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rplp1P47955 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rplp1P47955 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rplp1P47955 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rplp1P47955 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rplp1P47955 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rplp1P47955 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rplp1P47955 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rplp1P47955 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rplp1P47955 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rplp1P47955 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rplp1P47955 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rplp1P47955 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rplp1P47955 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rplp1P47955 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rplp1P47955 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rplp1P47955 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rplp1P47955 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rplp1P47955 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rplp1P47955 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rplp1P47955 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rplp1P47955 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rplp1P47955 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rplp1P47955 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rplp1P47955 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rplp1P47955 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rplp1P47955 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rplp1P47955 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rplp1P47955 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rplp1P47955 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rplp1P47955 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rplp1P47955 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rplp1P47955 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rplp1P47955 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rplp1P47955 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rplp1P47955 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rplp1P47955 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rplp1P47955 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rplp1P47955 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rplp1P47955 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rplp1P47955 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rplp1P47955 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rplp1P47955 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rplp1P47955 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rplp1P47955 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rplp1P47955 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rplp1P47955 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rplp1P47955 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rplp1P47955 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rplp1P47955 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rplp1P47955 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rplp1P47955 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rplp1P47955 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rplp1P47955 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rplp1P47955 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rplp1P47955 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rplp1P47955 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rplp1P47955 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rplp1P47955 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rplp1P47955 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rplp1P47955 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rplp1P47955 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rplp1P47955 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rplp1P47955 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rplp1P47955 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rplp1P47955 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rplp1P47955 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rplp1P47955 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rplp1P47955 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rplp1P47955 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rplp1P47955 Gm13323-201ENSMUST00000120245 1151 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Rplp1P47955 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rplp1P47955 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rplp1P47955 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rplp1P47955 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rplp1P47955 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rplp1P47955 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rplp1P47955 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rplp1P47955 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rplp1P47955 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rplp1P47955 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Rplp1P47955 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rplp1P47955 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms