Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SrprbP47758 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SrprbP47758 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SrprbP47758 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SrprbP47758 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SrprbP47758 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SrprbP47758 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SrprbP47758 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SrprbP47758 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SrprbP47758 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SrprbP47758 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SrprbP47758 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SrprbP47758 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SrprbP47758 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SrprbP47758 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SrprbP47758 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SrprbP47758 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SrprbP47758 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SrprbP47758 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SrprbP47758 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SrprbP47758 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SrprbP47758 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SrprbP47758 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SrprbP47758 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SrprbP47758 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SrprbP47758 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SrprbP47758 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SrprbP47758 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SrprbP47758 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SrprbP47758 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SrprbP47758 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SrprbP47758 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SrprbP47758 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SrprbP47758 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SrprbP47758 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SrprbP47758 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SrprbP47758 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SrprbP47758 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SrprbP47758 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SrprbP47758 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SrprbP47758 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SrprbP47758 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SrprbP47758 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SrprbP47758 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SrprbP47758 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SrprbP47758 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SrprbP47758 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SrprbP47758 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SrprbP47758 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SrprbP47758 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SrprbP47758 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SrprbP47758 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SrprbP47758 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SrprbP47758 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SrprbP47758 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SrprbP47758 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SrprbP47758 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SrprbP47758 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SrprbP47758 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SrprbP47758 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SrprbP47758 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SrprbP47758 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SrprbP47758 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SrprbP47758 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SrprbP47758 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SrprbP47758 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SrprbP47758 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SrprbP47758 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SrprbP47758 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SrprbP47758 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SrprbP47758 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SrprbP47758 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SrprbP47758 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SrprbP47758 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SrprbP47758 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SrprbP47758 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SrprbP47758 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SrprbP47758 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SrprbP47758 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SrprbP47758 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SrprbP47758 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SrprbP47758 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SrprbP47758 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SrprbP47758 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
SrprbP47758 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SrprbP47758 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SrprbP47758 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
SrprbP47758 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SrprbP47758 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SrprbP47758 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SrprbP47758 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SrprbP47758 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SrprbP47758 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SrprbP47758 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SrprbP47758 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SrprbP47758 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SrprbP47758 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SrprbP47758 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
SrprbP47758 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
SrprbP47758 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms