Protein–RNA interactions for Protein: P47239

Pax7, Paired box protein Pax-7, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax7P47239 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pax7P47239 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pax7P47239 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pax7P47239 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pax7P47239 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pax7P47239 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pax7P47239 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pax7P47239 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pax7P47239 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pax7P47239 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pax7P47239 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pax7P47239 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pax7P47239 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pax7P47239 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Pax7P47239 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pax7P47239 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pax7P47239 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pax7P47239 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pax7P47239 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pax7P47239 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pax7P47239 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pax7P47239 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pax7P47239 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pax7P47239 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pax7P47239 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pax7P47239 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pax7P47239 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pax7P47239 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pax7P47239 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pax7P47239 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pax7P47239 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Pax7P47239 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pax7P47239 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Pax7P47239 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pax7P47239 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pax7P47239 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pax7P47239 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pax7P47239 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pax7P47239 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pax7P47239 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pax7P47239 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pax7P47239 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pax7P47239 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pax7P47239 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pax7P47239 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Pax7P47239 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Pax7P47239 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pax7P47239 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pax7P47239 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pax7P47239 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pax7P47239 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pax7P47239 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pax7P47239 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pax7P47239 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pax7P47239 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pax7P47239 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pax7P47239 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pax7P47239 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pax7P47239 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pax7P47239 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pax7P47239 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pax7P47239 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pax7P47239 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pax7P47239 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pax7P47239 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pax7P47239 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pax7P47239 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pax7P47239 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pax7P47239 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pax7P47239 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pax7P47239 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pax7P47239 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pax7P47239 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pax7P47239 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pax7P47239 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pax7P47239 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pax7P47239 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pax7P47239 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pax7P47239 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pax7P47239 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pax7P47239 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pax7P47239 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pax7P47239 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Pax7P47239 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Pax7P47239 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pax7P47239 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pax7P47239 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pax7P47239 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pax7P47239 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pax7P47239 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pax7P47239 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pax7P47239 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pax7P47239 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pax7P47239 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pax7P47239 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pax7P47239 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pax7P47239 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pax7P47239 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pax7P47239 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pax7P47239 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms