Protein–RNA interactions for Protein: P46935

Nedd4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd4P46935 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Nedd4P46935 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nedd4P46935 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nedd4P46935 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nedd4P46935 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nedd4P46935 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nedd4P46935 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nedd4P46935 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Nedd4P46935 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nedd4P46935 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nedd4P46935 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nedd4P46935 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nedd4P46935 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nedd4P46935 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nedd4P46935 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nedd4P46935 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nedd4P46935 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nedd4P46935 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nedd4P46935 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nedd4P46935 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nedd4P46935 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nedd4P46935 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nedd4P46935 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nedd4P46935 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nedd4P46935 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nedd4P46935 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nedd4P46935 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nedd4P46935 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nedd4P46935 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nedd4P46935 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nedd4P46935 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Nedd4P46935 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nedd4P46935 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nedd4P46935 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nedd4P46935 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nedd4P46935 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nedd4P46935 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nedd4P46935 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nedd4P46935 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nedd4P46935 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nedd4P46935 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nedd4P46935 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nedd4P46935 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nedd4P46935 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nedd4P46935 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nedd4P46935 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nedd4P46935 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Nedd4P46935 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Nedd4P46935 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nedd4P46935 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nedd4P46935 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nedd4P46935 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nedd4P46935 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nedd4P46935 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nedd4P46935 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nedd4P46935 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nedd4P46935 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nedd4P46935 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Nedd4P46935 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nedd4P46935 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nedd4P46935 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nedd4P46935 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nedd4P46935 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nedd4P46935 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nedd4P46935 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nedd4P46935 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nedd4P46935 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nedd4P46935 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nedd4P46935 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nedd4P46935 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nedd4P46935 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nedd4P46935 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Nedd4P46935 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nedd4P46935 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Nedd4P46935 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nedd4P46935 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nedd4P46935 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Nedd4P46935 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nedd4P46935 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nedd4P46935 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nedd4P46935 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nedd4P46935 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nedd4P46935 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nedd4P46935 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nedd4P46935 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nedd4P46935 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nedd4P46935 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nedd4P46935 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nedd4P46935 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nedd4P46935 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nedd4P46935 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nedd4P46935 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nedd4P46935 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Nedd4P46935 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nedd4P46935 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nedd4P46935 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nedd4P46935 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nedd4P46935 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nedd4P46935 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nedd4P46935 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms