Protein–RNA interactions for Protein: P46638

Rab11b, Ras-related protein Rab-11B, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11bP46638 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab11bP46638 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab11bP46638 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab11bP46638 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab11bP46638 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab11bP46638 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab11bP46638 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab11bP46638 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab11bP46638 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab11bP46638 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab11bP46638 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab11bP46638 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab11bP46638 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab11bP46638 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab11bP46638 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab11bP46638 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab11bP46638 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab11bP46638 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab11bP46638 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab11bP46638 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab11bP46638 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab11bP46638 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab11bP46638 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab11bP46638 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab11bP46638 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab11bP46638 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab11bP46638 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab11bP46638 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab11bP46638 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab11bP46638 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab11bP46638 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab11bP46638 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab11bP46638 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab11bP46638 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab11bP46638 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab11bP46638 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab11bP46638 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab11bP46638 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab11bP46638 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab11bP46638 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab11bP46638 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab11bP46638 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab11bP46638 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab11bP46638 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab11bP46638 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab11bP46638 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab11bP46638 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab11bP46638 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab11bP46638 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab11bP46638 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab11bP46638 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab11bP46638 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab11bP46638 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rab11bP46638 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rab11bP46638 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rab11bP46638 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rab11bP46638 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rab11bP46638 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rab11bP46638 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rab11bP46638 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rab11bP46638 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rab11bP46638 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rab11bP46638 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Rab11bP46638 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab11bP46638 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab11bP46638 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab11bP46638 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab11bP46638 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab11bP46638 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab11bP46638 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab11bP46638 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab11bP46638 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab11bP46638 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab11bP46638 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab11bP46638 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab11bP46638 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab11bP46638 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab11bP46638 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab11bP46638 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab11bP46638 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab11bP46638 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab11bP46638 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab11bP46638 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab11bP46638 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab11bP46638 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab11bP46638 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab11bP46638 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab11bP46638 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab11bP46638 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab11bP46638 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab11bP46638 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab11bP46638 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab11bP46638 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab11bP46638 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab11bP46638 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab11bP46638 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab11bP46638 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab11bP46638 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab11bP46638 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab11bP46638 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms