Protein–RNA interactions for Protein: P46096

Syt1, Synaptotagmin-1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syt1P46096 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Syt1P46096 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Syt1P46096 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Syt1P46096 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Syt1P46096 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Syt1P46096 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Syt1P46096 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Syt1P46096 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Syt1P46096 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Syt1P46096 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Syt1P46096 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Syt1P46096 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Syt1P46096 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Syt1P46096 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Syt1P46096 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Syt1P46096 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Syt1P46096 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Syt1P46096 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Syt1P46096 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Syt1P46096 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Syt1P46096 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Syt1P46096 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Syt1P46096 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Syt1P46096 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Syt1P46096 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Syt1P46096 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Syt1P46096 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Syt1P46096 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Syt1P46096 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Syt1P46096 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Syt1P46096 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Syt1P46096 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Syt1P46096 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Syt1P46096 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Syt1P46096 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Syt1P46096 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Syt1P46096 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Syt1P46096 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Syt1P46096 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Syt1P46096 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Syt1P46096 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Syt1P46096 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Syt1P46096 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Syt1P46096 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Syt1P46096 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Syt1P46096 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Syt1P46096 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Syt1P46096 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Syt1P46096 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Syt1P46096 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Syt1P46096 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Syt1P46096 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Syt1P46096 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Syt1P46096 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Syt1P46096 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Syt1P46096 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Syt1P46096 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Syt1P46096 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Syt1P46096 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Syt1P46096 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Syt1P46096 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Syt1P46096 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Syt1P46096 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Syt1P46096 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Syt1P46096 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Syt1P46096 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Syt1P46096 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Syt1P46096 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Syt1P46096 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Syt1P46096 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Syt1P46096 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Syt1P46096 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Syt1P46096 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Syt1P46096 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Syt1P46096 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Syt1P46096 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Syt1P46096 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Syt1P46096 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Syt1P46096 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Syt1P46096 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Syt1P46096 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Syt1P46096 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Syt1P46096 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Syt1P46096 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Syt1P46096 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Syt1P46096 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Syt1P46096 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Syt1P46096 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Syt1P46096 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Syt1P46096 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Syt1P46096 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Syt1P46096 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Syt1P46096 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Syt1P46096 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Syt1P46096 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Syt1P46096 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Syt1P46096 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Syt1P46096 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Syt1P46096 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Syt1P46096 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms